501军团是西斯达斯·维达达斯·维德的精锐部队，在星球大战中曾参与不少重大事件或战役，令人印象深刻。501军团最初同其他克隆人部队一起，在吉奥诺西斯的岩漠参加了克隆人战争第一场历史性战役。

他们跟其他克隆人一样，潜入分离势力的堡垒，把邦联军逐出行星。不过，最高议长本人对501军团的出色战绩表现出特别的兴趣。在雷克斯上尉的带领下，501军团的核心小组被指派给阿纳金·天行者。他们俩默契配合，惯于把非常规的、时而显得鲁莽的任务战术转化成一次又一次银河共和国的胜利。

跟那些红色涂装的士兵一样，501军团不在遥远的卡米诺受训和成长，而是在科洛桑   的一处训练营。红色涂装的士兵组成帕尔帕廷的精锐突击部队。

这个属于绝密的营地只有少数经过帕尔帕廷挑选的指挥人员才知道。501军团的一些成员从总部被调动到其他部队。按照兵力部署图表，他们似乎很好地融入了所在部队。但在其它更私密的档案里，他们依然被仔细地记录为501军团的成员，以便有朝一日能返回科洛桑接受特殊任务。

在克隆人战争的最后日子里，501军团一直被频繁调动，在各个战场之间往来穿梭。军团被划分为若干别动队，经常增援其他克隆人部队。同时，他们在已有的指挥体系之外独立行事。在格里弗斯将军对首都发动的大胆袭击中，501军团也有士兵参加了捍卫科洛桑天空的战斗。军团的其他一些兵力还对费卢西亚、麦基托、尤塔帕和卡希克的克隆人部队提供支援。

战争结束时，达斯·维达屈服于黑暗面，向达斯·西迪厄斯效忠，成为达斯·维德。维德的第一个任务是摧毁绝地圣殿，其麾下是501军团的精锐克隆人士兵。独特的蓝色涂装盔甲把他们与其他部队区别开来。凭借精准的枪法和协调的团队策略，他们成功包抄困在圣殿里的绝地，无情地将他们击毙。这些克隆人士兵虽然在烈火中的圣殿内遭受重大伤亡——有的绝地被证明是很难对付的——但仍然成功完成任务。

501军团的很多早期任务长年都被列为机密。不过最近，有些成员的数据屏日记被曝光，披露某些最艰巨任务的细节。

他们赶到穆斯塔法，逮捕吉佐·德尔索，这个行为失常的的吉奥诺西斯机器人工程师在熔岩世界建立了自己的战斗机器人工厂。最令人震惊的是，501军团的克隆人还不得不镇压卡米诺的克隆人起义，因为卡米诺叛徒释放了一批异常的克隆人叛军。

死星设计图被义军间谍窃取后，501军团受命追查那个重要的技术资料读取器。该任务救了这支部队一命，使他们避免在雅文战役的高潮葬身于死星主反应堆的爆炸。