天启四年(1624),平定炎方驿(今云南曲靖
炎方乡)叛乱,升守备。天启五年(1625),与副总兵袁善一起,击退乌撒土舍安效良,斩首三百四十。
崇祯四年(1631),屯兵
临安区(今
建水县),讨伐阿迷州(今
云南省红河哈尼族彝族自治州开远市)土司普名声。普名声重金贿赂吾必奎,于是吾必奎与普名声、王弄土司沙源互相勾结。普名声被围,遣使游说吾必奎“兔死狐悲”。吾必奎深以为然,与普名声对战,假装失败撤退,引起明军溃败,云南巡抚
王伉阵亡。普名声身死,吾必奎愈加骄纵。
张献忠入川,黔国公
沐天波恐惧,于是派参将李大贽率两千人屯兵会川。李大贽与吾必奎不合,于是向沐天波告状。起初,沐府管家阮呈麟做事练达,善待少数民族,故云南数年无事,后余锡朋献谗言于沐天波,沐天波信而杀之,余锡朋成为新的沐府管家。