龙里长官司的历史始于明朝洪武年间，最初设立的是龙里驿站，随后在洪武五年（公元1372年）升级为龙里长官司。到了洪武二十三年四月，又设立了龙里卫并开始筑城。经过多次行政变更，最终在清朝康熙十一年（公元1672年），龙里长官司被撤销，改为设置龙里县。

明代初期，为了加强交通和军事防御，设置了龙里驿站。随着地方治理的需求增加，于洪武五年（公元1372年）正式成立龙里长官司。这一时期，还进行了城墙建设工作。到了洪武二十三年四月，龙里地区的行政单位再次提升，成立了龙里卫。然而，在洪武二十九年，龙里卫又被晋升为卫军民指挥使司。清代康熙十一年（公元1672年），随着行政区划的调整，原有的龙里长官司被废除，取而代之的是新设的龙里县。现今的贵州省龙里县就是在此基础上发展起来的。