天主教花莲教区（拉丁文：Dioecesis Hvalienensis），为天主教在台湾省东部设置的教区，成立于1963年，涵盖范围包括花莲县、台东县等东部县市。现任花莲主教为黄兆明主教，辅理主教为曾建次主教，教区内共有约55位神父及120位修女服务。由于东台湾的原住民比例较高，故本教区的教友以原住民居多。

1949年12月31日，罗马教廷将台湾的天主教会划为台北监牧区、高雄监牧区两大管区，台湾东部分属两个监牧区管辖。1952年8月7日，台湾的圣统制度正式建立，教廷将东部地区的花莲县及台东县独立出来，改设置花莲监牧区，由法籍的营口教区主教费声远担任监牧。1963年7月15日，教廷正式将花莲监牧区升格为正式教区，原任监牧的费声远主教成为教区首任主教，领署理之衔。花莲教区正式成立。

在历任主教及巴黎外方传教会等外籍修会的努力之下，使许多原住民领洗成为教友，更让东台湾省成为全台少数天主教徒较多的地区之一。1998年5月22日，圣·保禄二世任命卑南族的曾建次神父担任花莲教区辅理主教，同年8月29日正式就职，成为第一位晋升主教的原住民。