吴应科（1859—？），原名天保，英文名字：Woo Ying Fo，广东四会市会城镇人。同治十二年（1873年）14岁时，清朝选派第二批幼童赴美国留学，吴应科应考入选。留学期限原定15年。赴美后，吴应科先在麻州绿田城的罗木斯牧师家居住了5年，接着在安道威学校学习两年，然后升入瑞萨勒工学院。光绪七年（1881年），清政府将留美幼童全部撤回。吴应科尚未毕业即提前归国。旋奉派入福建马尾船政学堂（福州船政学堂）后学堂学习海军，为该学堂第八届驾驶班学生。毕业后，派入北洋政府差遣，积功赏五品军功，拔补把总。

光绪十五年（1889年）初，直隶总督、北洋大臣李鸿章为新成军的北洋海军拣员补署要缺，请准以吴应科升署北洋海军提督都司，充督队船大副。署缺三年改为实授，并升游击。

二十年（1894年），中日甲午战争爆发。八月十八日，北洋海军与日本联合舰队在黄海展开大战，吴应科随北洋海军旗舰“定远”号铁甲舰参加了海战，表现极为出色。李鸿章酌保海军出力员弁10人，吴应科得免补游击，以参将尽先补用，并赏“扬勇巴图鲁”勇号。赏戴花。十一年（1895年）初，北洋政府海军全军覆没，其武职实缺亦随其它幸存军官被清廷全部裁撤。

后历任海军蓝翎干总、北洋电讯局总办等职。二十五年（1899年），吴应科被重新起用，任头等翻译，奉派赴英国参加英皇爱德华七世登基大典。二十七年（1901年），调入江南制造局，任上海江南船坞总办、署理。负责管理船坞，积功以副将候补，加总兵衔。三十一年（1905年）初，经两江总督兼南洋大臣周馥奏请，将船坞从制造局中划出，改称“江南船坞”，交由总理南北洋海军的广东水师提督叶祖珪督察，以吴应科任总办。宣统三年（1911年）春，巡洋舰队统领程璧光奉派率“海圻”舰前往英国祝贺英皇加冕，以吴应科署理巡洋舰队统领，赏海军协都统衔。

中华民国元年（1912年），出任海军右司令两个多月即辞职。四年（1915年），又任北京政府交通部综核司司长。次年辞职，隐居北京市。

民国时期曾任海军右司令(海军中将衔)、海军部参议、南京总统府咨议、接收威海卫参赞等职。后其故居被称为“将军第”。