祁门站位于中国祁门县祁山镇高明村，是皖赣铁路上的一个中间站，建于1981年。邮政编码：245600。祁门站每日停靠1对旅客列车，另有一对来往通勤列车停靠，供车站及沿线铁路职工使用。在2020年之前，车站曾有K33/K34次列车和K45/K46次列车停靠。

1936年5月，京赣铁路工程局成立，开始全线勘测设计。此次将皖境铁路与赣境铁路分为两段，分别于1936年9月和1937年2月先后开工，1937年7月和10月相继铺轨。

1937年11月，南京市、宣城市相继沦陷，即将建成的皖赣铁路被迫停工。

1958年9月至1961年7月，先后两次开建，时间不长即停止修建。

1974年7月1日，皖赣铁路再次上马正式开工。

1975年10月，施工生产基本处在于停工状态。

1976年10月，随着“四人帮”的垮台，使一度瘫痪的六处重新振作起来。

1981年，皖赣全线贯通，12月起临管营运。

1982年10月1日，皖赣铁路全线通车，祁门站正式启动营运。时属中国铁路上海局集团有限公司南京铁路分局管辖。

2005年，全路裁撤铁路分局建制，祁门站划归上海铁路局芜湖车务段管辖，现为三等站。

2020年6月20日起，祁门站实施电子客票。

祁门站在皖赣铁路上行距离芜湖站312公里，下行距离贵溪站238公里。

祁门站站房总面积1116平方米，为徽派建筑风格。其中售票室面积40平方米，行包房70平方米。候车室位于站房中部，面积600平方米，可容纳400名旅客。

祁门站设有4条到发线和2座站台，其中1座站台设有雨棚覆盖。车站货场设有3座仓库和2条货物线。

客运：办理旅客乘降；行李、包裹托运。

货运：办理整车货物发到；危险货物仅办理农药、化肥发到。

祁门站周边设施包括祁门县粮食局、平安医院、祁门县社会公用汽车站以及祁山镇人民政府，为旅客提供了便利的社会服务和交通接驳。

2019年1月5日起执行