进化分类学（evolutionary taxonomy），也被称为进化系统学和综合分类学，是以进化论为基础的一种分类学分支。这种分类学体系旨在通过分类系统来反映生物间的亲缘关系以及它们的进化历史。进化分类学的发展始于C.von卡尔？冯？林奈的分类系统，后来由J.-B.de拉马克提出将系统按照低级到高级的顺序排列，从而更符合进化历史的观点。然而，直到C.R.查尔斯·达尔文的《物种起源》发表之后，进化分类学才被广泛接受。

进化分类学涉及到三个基本问题：物种概念、系统原理和特征分析。达尔文时代的进化论为分类学提供了三个重要启示：物种的可变性、亲缘关系的存在以及单系系统的构建。到了20世纪30、40年代，随着新系统学的兴起，这些问题得到了进一步发展。首先是在物种问题上，明确种群是物种的基本结构单位，并开展种下的亚种分类研究。其次是对种上进化和系统原理的研究，确立了分支系统和阶段系统这两个分类标准。最后是对特征分析的研究，强调分类特征必须源于共同起源，而非异源或平行特征。

自20世纪60年代以来，分类学领域出现了许多新的进展，进化分类学也不例外。根据现代遗传学提供的证据，可以采用新征与祖征对比的历史分析方法。每个物种都有其独特的种征，同时也有其所隶属于的上级单元的祖征。新征与祖征的关系是相对的，对于不同的层级来说，同一个特征可能既是新征也是祖征。

各级单元的特征有着特定的出现时序，这种时序反映了进化的阶段性历程。例如，天牛所属的昆虫纲、有翅亚纲、全变态类、鞘翅目等不同级别的特征，展示了天牛在其进化史上的五个主要阶段。

进化分类学的意义在于，它能够通过上下单元之间的特征时序反映出祖征的阶段发展，同时也能够通过对立单元之间的特征对比显示出新征的独特性质。物种作为进化和分类的基本单元，具有双重意义，这对于理解物种的概念及其在分类系统中的作用至关重要。