杭州市凤起中学成立于2002年7月，由原杭州市延安中学、杭州市韶山中学两校整体合并，重新组建而成。延安中学前身是私立淇园中学（含淇园中等补习学校）, 于1939年创办。学校位于杭州市延安路百井坊巷，校友中有多位杰出人物，如潘云鹤，孔胜东，和马云等。

2002年7月10日，为进一步提高下城区初中学校办学水平，满足人民群众对高质量教育的需求，整合教育资源，推进义务教育阶段均衡发展，经区人民政府批准，由原杭州市延安中学、杭州市韶山中学两校整体合并，重新组建杭州市凤起中学。

从2011学年起，因校安工程的原因，安吉路的初中部与启正中学的初一部迁入凤起，凤起中学的主权遭到了前所未有的打击。因此，凤起校园现在出现了“一园三制”的现象。2012学年起，最后一届初三学生毕业，以凤起中学为主体的部分全部并入春蕾中学，同时由于下城区百井坊巷片的拆迁问题，以及涉及到外国传教士土地的问题（司徒雷登），学校教学用地暂时保留。2014年9月起，拆迁问题谈妥，学校附近居民区，店铺全部拆迁，学校主体作为拆迁指挥部。2015年凤起中学原教学楼，行政楼做为医疗用地，开下城区天水街道卫生服务中心，原1号楼，2号楼，4号楼得以保存。

在2006年，杭州市教育局组织开展了“当好东道主，参与休博会”主题教育活动，旨在向世界宣传杭州，提升城市品牌，同时推动经济发展和提高市民文明素养。凤起中学积极响应，参与了该主题教育活动，培养学生的主人翁精神，并投入到休博会的各项活动中。学校学生参与了休博会的多种形式的休闲特色活动表演，展示了杭州市中小学生的形象。此外，学生们还参与了休博会期间的多项活动，如组成休博会外国学生宣传团、小记者团、小摄影团等，积极参与文化交流和校际交流活动，以及“2006杭州市世界休闲博览会项目——中外学生修学旅行交流活动”，接待了1000余名国外学生来杭修学旅行。通过这些活动，凤起中学的学生们有机会开阔视野、增长才干，并为杭州市的教育事业和文化交流做出了贡献。