祝启源先生1943年9月出生在广东阳山县，曾任中国社会科学院民研所(现改名为中国社会科学院民族学与人类学研究所)研究员，中国社会科学院研究生院教授，1998年3月病逝于北京市，终年55岁。

1966年毕业于中央民族学院（今中央民族大学）历史系，为支援西藏自治区的社会主义革命与建设，毕业分配时，自愿报名到西藏阿里工作，曾任中共西藏阿里噶尔县委、县革委办公室副主任。在藏工作期间，他关注边疆建设与生态发展，撰写了《门士煤矿的投入与产出问题的调查报告》、《关于保护生态环境，终止红柳过度砍伐问题的报告》等多份调查报告，为阿里地区的建设做出了贡献。

1978年以优异成绩考入于中国社会科学院研究生院民族学系，1981年毕业，获硕士学位。其后，他进入中国社会科学院民族研究所工作。

主要致力于中国民族史、特别是藏学领域的研究。祝先生对宋代藏族地方政权唃厮啰和中华民国的藏族历史，用功最深，成绩卓著，以其丰硕的成果倍受国内外学术界的关注。

《厮啰一宋代藏族政权》，青海人民出版社，1988年8月；赵秀英整理《青唐盛衰：唃厮啰政权研究》，青海人民出版社，2010年8月。

《祝启源藏学研究文集》，中国藏学出版社，2002年12月。

此外还与喜饶尼玛合著的《中华民国时期中央政府与西藏地方关系》一书，主持、通稿并参与写作了《西藏地方与中央政府关系史》。

1、《关于唃厮啰政权的几点考订》，《中国社会科学院研究生院学报》1981年第6期。

2、《唃厮啰政权形成初探》，《西藏研究》1982年第2期。

3、《解放后的藏族历史研究》，《中国社会科学院研究生院学报》1984年第5期。

4、《元代西藏地方驿站考释》，《西藏民族学院学报》1985年第3期。

5、《从金瓶掣签谈中央政府在西藏行使主权问题》，《民族研究》1989年第5期。

6、《和平解放西藏是西藏历史发展的必然归宿》，《民族研究》1991年第3期。

7、《孙中山民族主义的真谛》，《云南社会科学》1997年第1期。

8、《唃厮啰政权对维护中西交通线的贡献》，《中国藏学》1998年第1期。

9、《王森先生传略》，《佛学研究》2000年。