石站是广州地铁4号线的一座高架车站，位于中国番禺区石碁镇市莲路与广州—澳门高速公路交界东南侧的地块，于2006年12月30日启用。车站位于番禺区石碁镇市莲路与京珠北高速交汇之东南侧，共有两层，上层是候车站台，并采用侧式站台，设有站台安全门，地面为售票厅；本站设有两个出入口，分别为A、B。石碁站是四号线二期段首个地面高架联锁站，位于60米宽市莲路与京珠高速公路立交口东南侧。为地上三层建筑。车站公共区分为站厅、站台两层，下层为站厅层，上层为站台层。车站站台为侧式站台设计，两侧站台均设有安全门。

本站最早出现在2003年的方案中，当时规划的4号线得以沿京珠高速继续延长至南沙，本站作为新出现的4号线的中途站之一，位置与现时基本一致。随后本站随天津地铁4号线二期工程在2004年4月25日批复可行性报告。2006年12月30日，4号线二期首通段开通运营，本站正式启用。2012年3月6日清晨6时许，一辆满载易燃气体的油罐车在京珠高速行驶至石碁镇路段时，突然翻下7米路基，跌落在地铁四号线石碁站旁停车场内。受事件影响，本站关闭3个小时，所幸未造成人员伤亡。2022年年末疫情期间，本站曾受防控措施影响，于11月28日至11月30日下午暂停服务。

本站共有两层，地上二层为4号线月台；地面为站厅；车站附近为市莲路、广东女子职业技术学院等建筑，以及广州—澳门高速公路高架桥梁。

为方便乘客进出，收费区设于站厅中心，站厅收费区设有一台专用电梯、两台扶手电梯以及一组楼梯供乘客前往不同方向的月台。石碁站站厅设有少量自助服务设施供乘客享用，包括自动售卖机，以及车站内的“M-Touch”机，可查询地铁线路、首末班车等资讯以及地铁安全指引的查询，更亦供乘客登记为广州地铁荟会员、查阅奖分、换领奖赏。另外，本站的公共洗手间设于收费区的车站控制室旁，母婴室则设于站厅收费区东侧。

本站设有两个侧式月台，位于京珠高速西侧的上空。在本站南端西侧路轨设有一条存车线，如果海傍站至南沙客运港站出现故障而需要暂停服务时，南沙客运港方向的列车可以该站作为临时的终点站。在这种情况下，列车首先会在该站2号月台清客，之后会驶入存车线用作调头之用。其后，列车将会再经过月台南端的单渡线驶入该站1号月台，接载往黄村沿途各站的乘客，4号线的东涌站亦是类似设计。

石碁站现时共设有两个出入口供乘客进出，分别为A、B两个出入口。

石碁镇站是石碁、石楼两镇村民前往广州市最主要的交通工具之一。全天的出入闸客流虽然一般，但是在节假日的时候客流亦会有所上升。另外，本站是最接近番禺区著名景点番禺莲花山的地铁站，因此在地铁A出入口设置有直达莲花山的公交车，对于广州市区的居民来说，每逢春节、节假日以及观音诞的时候，本站都会出现大量前往莲花山观光的人士，出站接驳巴士等交通工具前往莲花山。

往黄村06:00-22:40方向首班车时间：06:29|末班车时间：22:29。

往南沙客运港06:21-22:15方向首班车时间：06:16|末班车时间：23:43。