厦门理工学院计算机科学与技术系于2006年11月成立，从原电子系分离出来。包括4个教研室、1个全校性
计算机中心和1个专业实验室。系部秉持“和谐、严谨、务实、创新”的系风，培养具有创新能力、掌握扎实专业技能的应用型计算机人才。截止2011年在校学生1300多人，每年招生500人。
计算机科学与技术：培养适应
厦门经济特区和
海峡西岸经济区建设的，具有良好的科学素质和人文素养，系统地掌握本专业基本理论、基本知识、基本技能与方法，具备一定创新能力、分析及解决实际问题能力的技能型、应用型高级专门人才。
物联网工程：培养适应海峡西岸经济区，尤其是
厦门市经济建设与社会发展需要，能够适应物联网的研究、开发、应用与
项目管理工作的“复合型”人才。
网络工程：培养市场急需的系统掌握
计算机科学与网络技术、网络工程的基础理论、专业知识和基本技能，具有开拓创新意识，能胜任计算机网络
通信系统和网络工程规划设计、计算机网络通信技术研发、计算机网络系统集成、调试、维护、管理和应用、计算机网络教育、
网络应用开发和部署实施等方面工作的等高等
工程技术应用型人才。
软件工程：培养具有良好的
软件技术与工程素养，系统地掌握软件工程的基本理论、基本技能与基本方法，接受严格的软件技术思维训练与工程实践训练，熟悉
服务外包规范，能够在国际性服务外包企业从事计算机应用及软件开发等软件工程方面工作的高素质应用型外包人才。
截止2011年10月，
计算机科学与技术系有各类教职工共72人，其中博士17人（
博士后4人），在读博士3人，具有海外留学和工作经历的教师14位，具有企业工作经历的教师13位，高级职称教师19位。
设有教学指导委员会、教学督导小组、
软件工程教研室、
计算机科学与技术教研室、
网络工程教研室、计算机公共课教研室、计算机中心和专业实验室。
建设有
福建省建筑智能企业工程技术研究中心、
厦门市建筑智能工程技术研究中心、厦门市软件体系结构重点实验室、
厦门理工学院应用软件研究所、厦门理工学院嵌入式系统研究所等多个教研平台。
拥有硬件完善的实验教学环境。实验室占地面积3000平方米，设备资产总额1500万元，建成完整的“337”实验室体系，包括3大中心（
计算机中心、
高性能计算中心、创新实践工程中心）、3大基础实验室（软件基础、硬件技术基础、计算机系统组装及维护）、7个专业/方向实验室（嵌入式计算系统、
网络工程技术、
软件工程、
信息安全与测评、数字内容与智能信息处理、虚拟与
仿真技术、智能楼宇），配置高档PC机1100台，每位学生实验时，均能满足一人一机的实验教学要求。
2008-2011年，承担了国家级项目4项、省级13项、市级及横向科研项目40余项，获省级以上科研奖励6项，拥有软件著作权8项，科研项目级别、数量、经费居全校前列。在三大检索发表论文70余篇。拥有软件著作权等专利成果10余项。举办了第二届全国
服务外包人才培养
高峰论坛常务理事会、2010年
福建省系统工程年会、2011年
厦门市计算机学会年会。被评为省级计算机实验教学示范中心、做中学计算机应用人才省级人才培养模式创新实验区。
拥有
计算机科学与技术省级特色专业、计算机组成原理、
软件工程省级精品课程、软件工程校级特色专业及4门校级精品课程。计算机科学与技术专业为校级“卓越工程计划”试点专业。
计算机科 学与技术系课外生活丰富多彩，学生会常年组织各式各样的活动。举办了趣味运动会、“微笑是一种美德”倡议活动、“假如我是
厦门理工学院校长”专题系列活动、举办“成才、成长、成功”系列讲座、
程序设计大赛等多项活动。