巴江河主要流经花都区的赤坭镇与炭步镇；巴江河上游与清远乐排河、佛山九曲河相交汇，中游与花都区内的天马河、新街河汇集后与流溪河在鸦岗交汇，最终经石门汇入珠江。这条花都区境内全长近30公里的河流，是广州市的上游水源，也是花都区巴江水厂、赤坭水厂，广州市区石门、西村、江村三大水厂的取水水源地。

巴江河曾是花都八景之一“巴江烟雨”的 所在，在花都区的版图上，巴江河曲曲弯弯，对花都人来说，巴江河就是一条母亲河,她用甘附的乳汁哺育了巴江河两岸勤劳的花都儿女。而今，随着两岸的生态环景不断遭到破坏，大量的工业 废水和生活污水倾入巴江，由南往北，溯江而上，可以看到30多家电镀、橡胶、水泥、漂染等重污染企业两岸林立。这些厂中，除了少数几间厂有较为完善的污水处理设施外，大部分的工业废水基本上是未经任何处理直接排入巴江河。另一部分工业废水经新街河、天马河汇入巴江，进入珠江造成间接污染，考验饮用水源的安全。

巴江河不仅是花都区三个镇的饮用水源，而且其汇入珠江处也是广州市石门水厂、西村水厂取水点等水源地。其跨界污染问题直接威胁花都和广州的饮水安全。

近年来广州市开始大力治理巴江河的污染问是，陆续关闭了河涌两岸的水泥厂等一大批大污染的企业，同时进行河涌两岸的截污工程，开建多间污水处理厂。

由于巴江水的污染是广州、佛山市和清远市三市的跨界问题，从2004年起广东省、广州市已多次召开协调会，联手治污，但因为上游区域排污总量、企业类型、达标管理等原因，水质状况并不稳定，污染威胁仍未能彻底解决。