《黑客帝国3：矩阵革命》（The Matrix Revolutions）是由沃卓斯基姐妹（现称为沃卓斯基姐妹）自编自导，基努·里维斯、劳伦斯·菲什伯恩、凯瑞-安·莫斯和雨果·维文主演的好莱坞科幻电影。该片于2003年11月5日在中国上映。

影片《黑客帝国3：矩阵革命》承接黑客帝国第二部的故事，以一场战争展开，地球上人类的最后一座城市——锡安面临母体机械大军的入侵，人类赌上所有武力发动最大攻势，尼奥、墨菲斯和崔妮蒂一行人也为此竭尽全力。崔妮蒂在与尼奥寻找机器大帝途中遇袭，悬浮船从高空坠落撞进大楼，崔妮蒂被大楼的钢筋贯穿身体。而尼奥也成功与机器大帝达成协议，阻止了机械哨兵对锡安的攻击并与机器大帝在矩阵中消灭史密斯干员。最后机器大帝带走了尼奥的肉体，尼奥依旧散发着光芒，让观众不由思考尼奥是否还活着。

《黑客帝国3：矩阵革命》全球票房累计约4273万美元（截至2024年2月19日）。该片入围第29届、第30届土星奖，第6届青少年选择奖及第10届中国电影华表奖。2022年1月14日时隔19年的黑客帝国系列续集《黑客帝国4：矩阵重启》在中国上映。

第二部最后时刻，尼奥用意念就解决了身后追击的机械哨兵，随后因体力不支晕倒在地。尼奥最后时刻觉醒的超能力让墨菲斯等人再次看到人类的希望。

墨菲斯和崔妮蒂跟着常薇来到了先知的住处，墨菲斯感觉眼前的先知似乎有点陌生。先知告诉墨菲斯，尼奥被困在一个连接矩阵世界和机器世界的地方，如果不及时救出尼奥将会永远困在那里。崔妮蒂询问先知拯救方法，先知告知他们火车人是关键。赛拉弗带崔妮蒂和墨菲斯到火车上看到火车人，更熟悉火车布局的火车人成功甩掉三人。

尼奥在一个陌生的地方醒来，唤醒他的是一个散发着白光的小女孩。尼奥从小女孩从得知火车驶向矩阵世界，而火车人掌控着哪能登上火车。随后他看到了小女孩的爸爸妈妈，他们都来自机器世界，通过学习模仿人类拥有了人类的情感，两人相爱并有了爱情结晶小女孩。然而每个程序的存在都有其目的，而没有存在目的的小女孩会被矩阵认为是废物程序而被删除。

小女孩的爸爸去求助先知，先知得知他们学会了人类的情感后决定提供帮助，因为他们为矩阵创造了程序进化的可能。于是先知让他们用她的外表终结代码与梅洛文奇谈判，为他的女儿争取到进入矩阵的名额，这也是先知变换样貌的根本原因。 

列车驶来尼奥希望跟着小女孩一家蒙混上车，却被火车人一眼识破，在火车站火车人为神，尼奥的超能力在这里也会失效，火车人一拳便击飞尼奥。临走时火车人告诉尼奥，如果没有梅洛文奇的命令，他将永远被困在这里。尼奥一直往前走才发现这里是一个循环，根本无法走出去。

另一边墨菲斯等人决定直接抓火车人的老板梅洛文奇，三人一路厮杀来到梅洛文奇面前。梅洛文奇提出用先知的全能之眼作为救出尼奥的交易筹码。墨菲斯等人知道这场交易绝无可能，先知若失去全能之眼便失去了存在目的，从而被矩阵删除；而梅洛文奇作为古老程序若得到全能之眼，就可以进行融合进化获得高级权限，从而威胁所有人的生存。于是双方大打出手，崔妮蒂趁机用枪顶在梅洛文奇的脑袋上，梅洛文奇看出崔妮蒂的认真和决心，最后选择直接放了尼奥。

场外协助的林克发现尼奥的代码被加密，即尼奥从架构师处得到升级进化，随后尼奥到先知住所与其见面，他还在此见到了火车站的小女孩。尼奥质问先知，为什么不告诉他架构师的存在，为什么要向他隐瞒有过前五代救世主的事实，为什么自己在现实世界还能徒手瘫痪机械，而先知只是表示时机未到。尼奥认为现在时机到了，他有必要知道更多的真相。

先知解释架构师的目的是维持矩阵平衡，所以前五代救世主都回归到了母体的主机源代码中，而先知目的却是要打断循环，从而打破矩阵平衡，让人类和机器的战争彻底终结，所以她给尼奥注入了爱这个不确定的因素，而尼奥也获得了更加强大的超能力。依据矩阵的平衡法则，万物有始必有终，当出现尼奥这一个变量时，就必定会诞生另一个变量，史密斯与之对应。尼奥越强大，史密斯就越强大，尼奥最大的威胁就是已经变异的超级病毒史密斯。最后先知告诉尼奥，无论人类和机器哪一方会赢，战争都会在12小时后结束，尼奥还有12个小时的时间做出选择，随后尼奥便回到了现实世界。

铁锤号帮助墨菲斯前女友奈奥比重启悬浮船，奈奥比与墨菲斯等人重聚。墨菲斯等人开会商议返回锡安的路线，12小时后锡安就会被机械哨兵攻破，他们必须赶紧返回锡安加强防御。此时尼奥突然打断众人，他思索先知之前的话，决定去地面上的机器城与机器大帝谈判。铁锤号船长觉得天马行空的尼奥在开玩笑，因为几百年来就没有人能进入机器城100公里，更别说进入机器城内部，但奈奥比却一反常态选择相信尼奥，并且将自己的悬浮船借给了他，因为先知曾告诉过奈奥比，将来有一天尼奥会遇到困难需要她的帮助。随后众人兵分两路，奈奥比和墨菲斯等人回防锡安，尼奥和崔妮蒂则前往机器城。

二人准备出发时发现悬浮船的电力系统出现故障，崔妮蒂来到电力供应室查看情况，贝恩趁机挟持了崔妮蒂。贝恩与赶来的尼奥打招呼，尼奥意识到眼前的人是史密斯，尼奥放下枪与贝恩展开搏斗。贝恩对准扣动扳机的前一刻，崔妮蒂关闭飞船电源，让尼奥躲过一劫。随即二人又开始扭打在一起，贝恩趁机用飞船电线电瞎尼奥双眼，但尼奥巧妙躲开了致命一击，并成功从贝恩手里夺走钢管击杀贝恩。

这是锡安有史以来处境最危险的一次，距离25万支机械哨兵入侵锡安的时间只剩20分钟，人类高级会议决定让老幼妇孺躲进锡安的最底层，然后在最高层船坞组建一只敢死队与机器大军对抗，指挥官下令所有反抗军队分成两队，第一队由人类驾驶的机甲组成重甲部队正面对抗机械哨兵，机甲配备两门30毫米口径的机炮，可以有效的杀死入侵的任何敌人。第二队是由毫无战斗经验的新人和散兵组成，新人负责为机甲补充弹药，空降部队则负责摧毁钻井机的钻头。15分钟后，所有机甲部队部署在船坞两侧严阵以待，步兵团则原地待命，时刻准备上场。

由于其他路线被毁，墨菲斯等人冒险选择满是机械哨兵的线路，奈奥比曾驾驶悬浮船安全走过这条路线，铁锤号也由奈奥比驾驶，奈奥比不熟悉铁锤号导致船底部刮到障碍物，巨大的响声引来大批的机械哨兵追击，奈奥比全力奔向锡安。铁锤号在狭窄的管道里一边逃跑，一边躲避哨兵的袭击，其余充当炮手反击追来的机械哨兵。奈奥比给锡安总部发送信息时几个哨兵集中力量摧毁了铁锤号的天线，后面有大批的哨兵追击，但前面又联系不上锡安，不能确保总大门能不能打开。

关键时刻锡安总部的雷达侦测到铁锤号正在向三号门靠近，毫无驾驶经验的马克笨拙的操控着机甲摇摇晃晃的向着三号门走去，可就当他即将到达门前时，突然出现一批哨兵拦住了他的去路，马克举起机炮轻松解决，然而他快到终点时，一只机械哨兵发动袭击将他撞倒，林克的妻子及时赶来消灭了哨兵，紧接着马克扣动扳机打断链条，终于在最后一刻打开了大门。冥冥之中只有墨菲斯感觉到这是尼奥在保护他们。

尼奥为控制前方的哨兵，无暇顾及身后，只能让崔妮蒂将悬浮船开向高空，利用云层中的闪电解决哨兵。由于悬浮船不能保持在高空中持续飞行，悬浮船飞到一定的高度后船体彻底失去了动力，惯性让悬浮船成功冲破云霄，崔妮蒂第一次看到的那颗明亮而又美丽的太阳。失去动力的悬浮船开始急速下坠，下坠期间崔妮蒂不断尝试重启悬浮船，最后一刻悬浮船才成功重启，悬浮船直接撞进了一座大楼里，崔妮蒂被大楼的钢筋贯穿身体。

尼奥悲痛欲绝，愣在原地，久久不能接受，他恨自己即使拥有了最强大的能力也难以挽回逐渐冰冷的爱人。人工智能的宗旨是让自己存活并运行，想要让矩阵维持良好的运行状态，那就必须先除掉史密斯这个超级变态的病毒，于是机器大帝与尼奥达成交易，并发出指令叫停了第二波攻击锡安的哨兵，这就是为什么机械哨兵会突然停止攻击的原因。

尼奥重新回到矩阵世界，发现原本美好的矩阵已经被史密斯搞得乌烟瘴气，所有人类的意识都被他侵入同化，矩阵内除了史密斯还是史密斯。史密斯没有招呼自己的分身上场，亲自上场与尼奥决斗，近身肉搏再到远程攻击，二人不相上下，但由于史密斯吞噬并侵占了先知的大脑，让他的运算能力大幅超前，尼奥渐渐落于下方。史密斯嘴里说出万物有始必有终，意识到不好的事要发生，因为这句话其实是先知从史密斯口中说出来，侧面也说明了先知并没有被他完全吞噬。为避免事态彻底脱离他的掌握，气急败坏的史密斯准备吞噬侵占尼奥，而尼奥也没有反抗，任由史密斯同化，因为此刻的尼奥终于明白了先知的那句话，万物有始必有终，一切开始于他，那么注定也会结束于他，尼奥是故意让史密斯同化自己。

史密斯进入尼奥现实世界的大脑意识，而这也给了机器大帝直接处理史密斯的机会，机器大帝对着尼奥的本体输入大量的数据，伴随着白光的射出，矩阵里被史密斯同化的尼奥发生爆炸，紧接着史密斯的本体也开始自曝和他共用代码的复制体也全部灰飞烟灭。伴随着水泥路面的重新恢复，整个矩阵系统也完成一次重启进化，所有被史密斯侵占的人都恢复了原来的样子。与此同时，现实世界里所有的机械哨兵开始撤退，锡安城终于迎来了难得的安宁。城市某处的草坪上，先知与matrix的设计者谈话，似乎这一切是他们俩的游戏。最后机器大帝带走了尼奥的肉体，尼奥依旧散发着光芒，让观众不由思考尼奥是否还活着。

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这部电影的预算估计在1.5亿美元。

尼奥与史密斯的决战源于1999年的韩国影片《无处藏身》。

在最后决战和片尾字幕中旁白的梵语的意思是：“引领我从虚幻到现实，引领我从黑暗到光明，引领我从短暂到永恒。”

片中有804个特效镜头，而且几乎每个特效镜头中都有真实表演成分。

剧组只建造了一个全尺寸APU，模型重达2吨。

尼奥与史密斯特工的巅峰对决中，滂沱大雨气势逼人，有别于其他影片中的雨景，因为新装备可以让水不停循环和净化，而且制造的雨滴额外硕大。

为了营造空中场景的失重感，特技和特效部门携手发明了一种名为"Tuning Forks"的装置，这是一种能让演员和特技人在打斗时模拟失重状态的特殊索具。

尼奥与史密斯特工的颠峰对决是《矩阵革命》中的重头戏。为了拍摄这段场景，剧组耗费了8周时间，而之前的准备工作更长达数月。

片中使用的其他索具还包括由基努·李维斯的替身乍得·斯塔赫尔斯基(Chad Stahelski)发明的"翻转带"，可以让演员向任何方向翻滚。

《矩阵革命》中的另一段违背重力的场景出现在"地狱俱乐部"的存衣处。为了拍摄这段场景，摄影棚的天花板上安装了轨道系统，以让倒挂着的演员和特技人员确定移动方向，"翻转带"页帮助演员完成了很多特技打斗。

拍摄弹坑中的打斗和对话镜头是雨果·维文经受的最大挑战，他回忆说："雨很大，难以开口讲话，下得冒泡的雨水会从嘴里溢出来。你听不见自己讲话，所以在这段戏里要找对语调真的很困难，因为我不知道自己发出的声音是什么样的。

特技协调总监R·A·罗德尔(R.A.Rondell)总结说："我们在制作这些影片时达到了如此高的水准，以至再从事其他任何项目都会显得有些差强人意。为了力求完美,我们曾在一天中拍过70个镜头。我们都变成了超级完美主义者，不超常发挥就会失望不柜。

基努·里维斯这部电影的片酬是1500万美元，相当于每分钟电影影进账40万美元。

船的概念来源于神话中索尔的锤子,总是能够自动回到它的主人身边。

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影片的预算约为150,000,000美元。2003年11月09日，影片在北美地区首映，首周票房为48,475,154美元，北美地区总票房为139,313,948美元，全球总票房为427,344,325美元（数据统计截至2024年2月19日）。

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虽然与现在好莱坞炙手可热的超级英雄电影相比，《黑客帝国》“三部曲”共计16.2亿美元的全球票房，只能说是小巫见大巫，但在新世纪之交也是风头无二。更值得一提的是，该系列故事结构的层层剥茧、视觉效果的大胆创新（比如著名的“子弹时间”）、关于人类与人工智能关系的思考、存在主义的哲学思辨等等，都令它成为无可争议的科幻经典，甚至有人称之为最完美的系列电影。（中青网评）

第三部给《黑客帝国》系列画上圆满的句号。（《波士顿环球报》评）如果你不太喜欢第二部，那对第三部也不会有多少好感，因为它与第二部走的是一条路。（《芝加哥先驱报》评）比第二部要好，但紧张的气氛与惊险的场面已不复存在。（《好莱坞报道者》评）第三部感觉非常重复，像你在玩一个游戏，只是控制按钮掌握在别人手中。（《纽约邮报》评）少了很多悬念。（《纽约时报》评）沃卓斯基兄弟因为犯了保守的错误，所以第三部有些东西没有展开。（《滚石杂志》评）

2021年《黑客帝国4》上映，作为《黑客帝国》三部曲最初期的编剧和一直以来的导演，沃卓斯基姐妹在三部曲中描绘了一个环环相扣、相当完整的故事，本就没有给续集留下任何空间。此番强行重启，剧情便只能如第一部一般，让主角尼奥重新从虚拟世界中再度苏醒一次。只不过，无论是武戏中该有的华丽特效和精彩打斗，还是文戏中该有的哲学探讨，第四部相较于第一部而言，不是机械复用，就是全面降级。（虎嗅网评）

2019年8月20日，黑客帝国系列的出品方华纳兄弟影业的主席托比·艾默里奇（Toby Emmerich）正式宣布《黑客帝国》重启，基努·里维斯、凯瑞-安·摩斯、拉娜·沃卓斯基等“三部曲”的主创也全部回归。《黑客帝国4》由沃卓斯基姐妹中的姐姐拉娜·沃卓斯基（Lana Wachowski）担任主创。2021年11月23日《黑客帝国4：矩阵重启》宣布确认引进中国，然而时隔十几年的黑客帝国系列续集在豆瓣上107508人评分为5.7（截至2024年2月19日），远低于黑客帝国“三部曲”。