赣南医学院第三
附属医院原名南昌铁路局赣州医院，创建于1996年7月，是
江西省目前唯一独立设置普通本科西医院校—赣南医学院直属附属医院之一。医院坐落于京九明珠
赣州站旁，位于
五洲大道与京九路交叉路口，交通便利，环境幽雅，是一所学科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研于一体的综合性医院。
赣南医学院第三附属医院医疗设备齐全拥有诸多国际先进设备如：
德国产大功能激光碎石机、
英国产超脉冲、等离子
前列腺电切镜、
美国史赛克 腹腔镜 关节镜、德国产全套泌尿腔镜、德国蛇牌骨科动力系统、
意大利VILLAC型C臂机、进口床边X光机等专科设备；还有美国产全身CTGE彩超等先进的诊疗设备价值达余万元。
医院设有急诊科、内一科（心血管内科、
消化内科、
神经内科）、内二科（呼吸内科、肾内科、内分泌科、风湿科）、内三科（老年医学科、安宁疗护中心）、外一科（骨科、神经外科）、外二科（普外科、泌尿外科、结直肠科）、妇产科、
儿科学、中医科、康复医学科、麻醉科和重症医学科等临床科室，设有内窥镜室（胃肠镜、
支气管镜）、高压氧治疗室，设有检验科、病理科、药剂科、影像科、超声医学科、体检科、供应室等医技科室。门诊部设有口腔科、五官科、
皮肤科、中西医结合科。
医院现有职工380余人，其中高级专业技术人员27人，博士1人，硕士14人，硕士生导师2人、
江西省卫生系统学术与技术带头人江西省新世纪千百万人才工程人选各1人。
赣州市卫生系统第一批学术和技术带头人培养对象2人，赣州市优秀青年医学人才培养对象1人。赣州市医学会各专业委员会主任委员1人，副主任委员8人，常务委员30余人。江西省医学各专业委员会副主任委员1人，常务委员10余人。