秦慧芬受父亲的影响，自幼便爱看戏。她与
梁秀娟、
章遏云、马述贤等四人，被视为“
四大名旦”的传人，其《
》等梅派戏堪为典范。九岁时，她进入“厉家班”，该班与夏声剧校，在抗战期间，是扬名川、陕之间的两大科班。在厉家班时，秦慧芬并未学习青衣，而是学小生，专工扇子（文生）。到了十六岁才定的青衣，青衣由
王蕙芳启蒙，先学了《胭脂虎》《
十三妹》《浣花溪》等，因此她的戏路是旦角、小生皆能演。
1947年，秦慧芬在上海拜
梅兰芳为师，当时她二十三岁，梅师五十三岁。1948年，秦慧芬与敏结婚，隔年随夫婿来台。来台后，曾加盟陆光国剧队，1957年因身体不适感冒发烧，硬着头皮抱病上台，结果一曲终了，声带充血，坏了嗓子，由于嗓子是京剧演员的本钱，秦慧芬等于是被迫退出。然而她退而不休，转到幕后专以教戏为业，在文化学院、小大鹏、小陆光担任旦行老师，传授她的梅派演唱的技巧，门下弟子有
魏海敏、王耀星、胡陆蕙、
王凤云、王凤娟、吴陆君、
王复蓉、余啸云等多人。而在停演之后，秦慧芬仍偶尔应邀登台。
在台湾的
梅兰芳女弟子还有
章遏云、
顾正秋等，曾长期在台的梅兰芳男弟子只有20世纪末从英属香港到台湾的
陈永玲。