截至2019年10月，珍秦镇下辖1个社区和11个牧委会，包括杂麻牧委会、叉麻龙牧委会、松然贡牧委会、色宝结然牧委会、冈青牧委会、色然牧委会、仲宗牧委会、勒青牧委会、措龙牧委会、乐然牧委会和东莫牧委会。
珍秦镇境内南北耸立着海拔5000米以上的5座高山，中间为扎曲河谷滩地；境内地形复杂，地势高耸，
平均海拔4300米左右。
珍秦镇多年平均气温2.9℃，极端最低气温-25℃，气温日差较大，全年只有冷暖季之别，无明显的四季之分，年无霜期90天左右，降水量560毫米，
太阳辐射强，日照时间长。农作物生长期125—150天左右。被称之为“
康巴藏区母亲河”的雅袭江江源扎曲（河）横穿境中。
珍秦镇境内主要矿产有铜、锰等资源；其他自然资源中，动植物资源丰富，其中有
马鹿、
白唇鹿、
黑颈鹤、
藏雪鸡、
岩羊等珍贵保护动物；鲤鱼、
小黄鱼、
大黄鱼等
渔业资源也很丰富；有野生黄蘑菇、
菌子、
冬虫夏草图等菌类物种。有
雪莲花、冬虫夏草、
党参等野生药用植物；还有
风能和水能资源也极为丰富。
珍秦镇主要是
2008年中国雪灾，每3—5年发生1次，多发生在年末的11月至次年3月之间。
珍秦镇属纯牧业乡镇，天然草场总面积476.9万亩，其中可利用草场面积367.1万亩；2011年，各类牲畜年末存栏21315头（只、匹），其中牛20110头，羊1057只，马148匹；牧民人均纯收入2065元。
2011年，珍秦镇企业主要有巴颜喀拉乳业公司，职工15人；采取“基地＋牧户”的形式大力发展酸奶制作与销售，在214国道沿线的酸奶销售点已达25处，联户经营牧户585户，年实现酸奶销售收人达265万元，每户创收4529元。
2011年末，珍秦镇有镇卫生院1所，专业卫生人员3人；牧区
新型农村合作医疗参合人数7135人。
青海省至
西康省的公路穿越珍秦镇境内，为该镇提供了便捷的交通条件。