周仲孙，字元孙，东晋时期的政治人物，出生于汝南郡安成县。他是周访的孙子，周光的儿子。

在司马丕兴宁初年，他担任宁州军事督察，振武将军以及宁州刺史。他在宁州的统治期间，被指贪污暴虐，导致民众生活困苦。司马奕太和六年（371年），他再次被任命为益州、河南省、梁州三郡的监察官，同时也是益州刺史。司马曜宁康初年，他被转任梁益二州的镇守。在前秦苻坚派遣仇池人杨安攻打蜀地时，周仲孙的军队战败，因此被免去官职。他在后来被征召为光禄勋，但在任期间去世。