上海市市伊斯兰教协会是上海各族穆斯林的爱国宗教团体，成立于1962年8月21日，最初会址位于黄浦区小桃园街52号，后来迁移至西仓桥街117号。

1962年3月，上海市伊斯兰教协会筹备委员会成立，由13名伊斯兰教界的爱国人士、清真寺的阿訇和乡老代表组成，沙彦楷担任筹委会主任。同年8月21日，上海市伊斯兰教第一次代表大会召开，选举产生了第一届委员会，沙彦楷被选为主席。然而，由于文化大革命的影响，市伊协于1966年开始停止活动。1979年6月，市伊协恢复工作，积极参与落实宗教政策等工作。此后，市伊协分别在1982年12月、1986年7月29日、1990年12月6日、1995年9月11日、1999年6月28-29日、2004年9月28-29日、2012年2月召开了历次代表会议，不断更新和完善协会的领导层。

上海市伊斯兰教协会的最高权力机构为上海市伊斯兰教代表会议，每四年举行一次，必要时可以提前或推迟召开。代表会议产生的委员会是协会的常设机构，负责日常工作的决策和执行。协会设有会长、副会长、秘书长等职务，均由委员会选举产生。此外，协会还设立了名誉会长、顾问、副秘书长等职位，以辅助协会的运作。

上海市伊斯兰教协会的主要职责包括贯彻宗教信仰自由政策，团结联系穆斯林群众，组织教长、阿訇、学者研究伊斯兰教教义，办好教务，指导清真寺的教务活动。同时，协会还协助政府落实宗教政策，开展穆斯林的正常宗教生活，建立回族殡葬服务组，协助开放回民公墓。在文史资料方面，协会收集、整理上海伊斯兰教的相关资料，并参与相关书籍的编写。在对外交往上，协会积极开展与国际穆斯林间的友好交流，接待来访代表团，并参与组织朝觐活动。此外，协会还致力于解决宗教自养问题，通过发展经济实体等方式实现这一目标。

上海市伊斯兰教协会的章程规定了协会的名称、宗旨、任务、组织结构、职权划分、经费来源等事项。章程明确了协会的最高权力机构为上海市伊斯兰教代表会议，委员会作为常设机构，负责协会的具体工作。章程还规定了会长、副会长、秘书长等职务的产生方式，以及协会的经费来源和会址位置。