吴征植物学奖由中国植物学会和云南吴征镒科学基金会于2016年7月12日开展吴征镒百年诞辰纪念活动时联合设立，这是全球首个植物学专业奖项。该奖项每两年评选一次，设杰出贡献奖一名（奖金：人民币50万元）；青年创新奖两名（奖金：人民币20万元）。

吴征镒植物学奖由中国植物学会和云南吴征镒科学基金会于2016年7月12日开展吴征镒百年诞辰纪念活动时联合设立。该奖项每两年评选一次，设杰出贡献奖一名（奖金：人民币50万元）；青年创新奖两名（奖金：人民币20万元）。这是全球首个植物学专业奖项。2017年是吴征镒植物学奖的首届颁奖年。本次会议评选出的获奖名单，将于2017年7月底在我国深圳召开的“第十九届国际植物学大会”上正式公布。首届评奖会在中国科学院昆明植物研究所完成评审。本次评审会议评选出杰出贡献奖一名，青年创新奖两名。

2022年7月19日上午，第三届吴征镒植物学奖在南京市揭晓，第三届吴征镒植物学奖杰出贡献奖获奖人为中国科学院昆明植物研究所研究员李德铢，青年创新奖获奖人为中国科学院西双版纳热带植物园研究员星耀武、中国科学院植物研究所研究员焦远年。