山西医科大学附属医院（山西医科大学第一医院）是一座综合性三级甲等医院，同时还是山西医科大学第一临床医学院，医院拥有肿瘤治疗中心、神经内科、甲状腺科等多个科室，致力于为患者提供高质量的医疗服务。

山西医科大学第二医院（山西医科大学第二临床医学院，山西红十字医院）创建于1919年，是一所三级甲等医院。

有血液内科、骨科、心胸外科、心脏内科、呼吸内科、影像医学科、康复医学科、风湿免疫科、耳鼻咽喉科、内科学（心内科、呼吸内科、血液内科、消化内科、肾内科、内分泌科、风湿免疫科）、外科学（骨科、心胸外科、普外科、神经外科、泌尿外科、血管外科、整形科）、耳鼻咽喉科等科室。

山西医科大学第三医院地处迎泽大街南寒广场，是一家综合性二级甲等医院。

山西医科大学口腔医院是一所三级专科医院。

设有口腔内科、口腔颌面外科、口腔修复科、口腔正畸科、贵宾会诊科和口腔预防保健科、口腔急诊科等7个临床科室；消毒供应室、病理科、药剂科、放射科、检验科、技工室等6个医技科室。