重庆市国家税务局于1997年6月28日正式成立。截止2012年底，全局共有干部职工6370人，离退休职工2417人。重庆市国家税务局设有16个处室，5个事业单位，下属38个区县（自治县）局，6个开发区局，1个保税港区局、5个直属单位和284个税务所（税务分局）。全市国税系统管辖纳税人57.53万户。

2018年6月15日，新组建的国家税务总局重庆市税务局挂牌成立，标志着原重庆市国家税务局、原重庆市地方税务局自此正式合并。

重庆市国家税务局成立于1997年6月，下辖区县局和直属单位53个，其中：区级国税局24个，县级国税局15个，开发区国税局5个，直属单位8个，税务干部学校1个；全系统有基层分局和税务所300个。主要负责国内增值税、国内消费税、企业所得税、车辆购置税和出口货物退（免）税等中央税和中央地方共享税的征收管理。全系统管理服务纳税人150万户，税源主要集中在汽车、烟草、电力、电子信息、金融等重点行业。

“十二五”期间，全市国税部门累计组织收入4256.3亿元，年均增长14.2%。其中，地方级收入累计完成1093.7亿元，年均增长18.2%，税收规模在全国排位从“十二五”初期的第25位上升到第18位，在西部地区从第7位上升到第4位；五年来累计减免税金800亿元，办理出口退税396.7亿元。其中，2015年全市国税部门组织收入突破千亿元大关，达到1094亿元，同比增长12%。中央级收入完成792亿元，增长10.5%；地方级收入完成302亿元，增长16.2%，圆满实现总局和市委市政府下达的目标任务。不断优化纳税服务，着力加强干部队伍建设和精神文明创建，树立了良好的行业形象，得到了社会各界的充分肯定。全市国税系统先后被重庆市委、市政府命名为重庆市首批文明行业，市局机关和12个区县局被命名为全国文明单位，98%的一线征管单位被各级命名为文明单位，涌现出了一大批全国劳模、全国五一劳动奖章获得者等先进个人。

2011年12月，获得中央精神文明建设指导委员会授予的“第三批全国文明单位”荣誉称号。

（一）贯彻执行税收法律法规、部门规章及规范性文件，并结合本地实际情况，研究制定具体的实施办法。

（二）贯彻执行税收征收管理法律法规、部门规章及规范性文件，研究制定具体的实施办法，组织实施本系统税收征收管理改革。

（三）根据重庆市经济发展规划，研究制定本系统税收发展规划和年度工作计划并组织实施。

（四）负责本地区中央税及共享税的征收管理、税源管理、纳税评估、反避税和稽查工作，力争税款应收尽收；负责增值税专用发票、普通发票和其他税收票证的管理工作。

（五）监督检查本系统的税收执法活动和内部行政管理活动；负责税务行政处罚听证、行政复议和行政应讼工作。

（六）负责规划和组织实施本系统纳税服务体系建设；制定和监督执行本系统纳税服务管理制度；贯彻执行纳税人权益保障规章制度，研究制定具体的实施办法；监督实施注册税务师管理制度。

（七）组织实施对纳税人进行分类管理和专业化服务，组织实施对大型企业的纳税服务和税源管理。

（八）编制、分配和下达本系统税收收入计划并组织实施；负责本系统的税收会计、统计核算工作。

（九）负责规划和组织实施本系统税收管理信息化建设；制定本系统税收管理信息化制度；承担本系统金税工程的推广和应用工作。

（十）负责本地区进出口税收和国际税收管理工作。

（十一）组织开展本系统党风廉政建设、反腐败工作及行风建设。

（十二）垂直管理本系统的机构、编制、人员和经费等工作。

（十三）承办国家税务总局和重庆市委、市政府交办的其他工作。

重庆市国家税务局设立14个内设机构（正处级）、8个直属机构（正处级）、5个事业单位（正处级）。

1.办公室

拟订本系统年度工作计划、有关工作制度；组织起草和审核市局重要文稿；负责机关文电、机要、会务、档案、督办、信访、保密、密码等工作；承担面向社会的税收宣传、新闻发布及机关政务公开、政府信息公开工作；承办网站运行和维护工作；管理机关财务和其他行政事务；组织办理人大代表议案、建议和政协委员提案的有关事项。

2.政策法规处

拟订并组织实施本系统依法行政、依法治税工作方案；组织协调涉及多税种、综合性税收政策的落实工作；组织开展综合性税收政策调研；承担机关有关规范性文件的合法性审核工作，并定期进行清理、评估和反馈；承办局外涉及多税种、综合性税收政策文件会办工作；牵头重大税收案件审理及规范税务行政审批工作；承办税收规范性文件的备案备查工作；办理行政复议、赔偿案件及行政诉讼案件；组织反补贴案件的应对工作。

3.国家税务总局货物和劳务税司处（进出口税收管理处）

组织实施增值税、消费税、车辆购置税的征收管理工作，拟订征收管理具体实施办法；对有关税种的具体业务问题进行解释和处理；组织实施有关税种的纳税评估、税源管理等办法；管理增值税专用发票和车辆购置税票证；指导有关税种的日常管理、日常检查；参与有关税种的纳税辅导、咨询服务、税收法律救济工作。

组织实施进出口贸易税收管理工作，拟订税收管理具体实施办法；参与编制年度出口退（免）税计划，分配下达年度内退税计划；组织实施出口退税管理工作；监督检查进出口税收政策的执行情况。

4.所得税处

组织实施企业所得税、储蓄存款利息所得税和法律法规规定的基金（费）等征收管理工作，拟订征收管理具体实施办法；对有关税种的具体业务问题进行解释和处理；组织实施有关税种的纳税评估、税源管理、税基管理、汇算清缴等办法；指导有关税种的日常管理、日常检查；参与有关税种的纳税辅导、咨询服务、税收法律救济工作。

5.收入规划核算处

牵头编制年度税收计划、出口退（免）税计划，分配下达年度免抵调库计划；监督检查税款缴、退库情况；组织开展税收收入分析预测、税收收入能力估算及重点税源监控、企业税收资料调查工作；组织落实税收会计核算、税收票证管理等相关制度；承担税收收入数据的综合管理应用工作，对外发布税收收入数据。

6.纳税服务处

组织、协调和指导本系统各部门、各税种、各环节的纳税服务工作；组织实施纳税服务工作规范和操作规程；组织落实纳税人权益保障规章制度及规范性文件；组织协调、实施纳税辅导、咨询服务、税收法律救济等工作，受理纳税人投诉；组织实施税收信用体系建设；指导税收争议的调解；组织实施面向纳税人的税法宣传。

7.征管和科技发展处

组织落实综合性税收征管法律法规、部门规章及规范性文件，拟订具体操作办法；研究提出专业化征收管理和税收征管规程完善的建议；组织实施税收征管数据管理和应用办法、综合性纳税评估办法，承办征管质量考核、风险管理和税收收入征管因素分析工作；承担税务登记、纳税申报、普通发票管理、税控器具推广应用等工作；组织落实个体和集贸市场税收征管、税收管理员制度。组织落实税收管理信息化建设规划、方案、制度；组织实施本系统信息技术体系建设和监督、验收；承担税收管理信息化建设项目立项、技术标准、业务需求、资金使用等方面的管理工作；承担税收管理信息化制度建设和监督检查。

8.财务管理处

拟订财务管理、基本建设管理等办法；审核汇编部门预算、决算；组织实施会计核算、会计基础规范工作，分析考核征税成本；组织实施国库集中支付工作，办理具体支付事项；组织实施本系统资产的购置、占有、使用、处置、清理等工作；承担着装管理工作。

组织落实政府采购规章制度，拟定具体实施办法和操作规程；拟订年度采购计划，办理具体采购事项；规范本系统政府采购业务管理，防止和化解采购风险。

9.督察内审处

组织实施税收法律法规、部门规章及规范性文件执行情况的监督检查；组织实施财务管理、基本建设项目、大宗物品采购审计和领导干部经济责任审计工作；组织落实税收执法责任制制度、税收执法过错责任追究制度，承担税收执法质量考核工作；督察落实税收执法检查结论和各类审计结论。

10.人事处

组织落实干部人事制度及税务人才队伍建设规划，拟订具体实施方案；承担人事、机构编制和公务员管理工作；承担工资、人事档案、专业技术职务管理等工作；承担下一级领导班子及领导干部和后备干部的管理、考核及监督等工作；监督检查本系统执行干部人事规章制度情况；办理出国政审事项。

11.巡视工作办公室

组织落实巡视工作制度，拟订具体实施办法；拟订年度巡视工作计划，组织开展巡视工作；监督检查下一级领导班子及领导干部执行政治纪律、组织纪律、群众工作纪律和党风廉政建设等方面的情况；落实、协调、督办干部监督工作联席会议领导小组议定、决定事项。

12.教育处（思想政治工作办公室）

拟订并组织实施人员培训、学历教育管理制度、工作规划、年度计划；组织开展培训质量考核与评估；承办教育培训项目的开发与管理；承担教育培训经费管理和培训机构业务管理工作；指导、检查本系统教育培训工作；组织实施系统党建工作；组织实施本系统思想政治工作、精神文明建设、税务文化建设和基层建设。

13.监察室

组织落实纪律检查、行政监察工作制度，拟订具体实施办法；监督检查本系统各级机关及工作人员贯彻执行党的路线方针政策和遵守国家法律法规、部门规章情况；监督检查本系统各级领导班子及其成员维护党的纪律、贯彻民主集中制、选拔任用干部、贯彻党风廉政责任制和廉政勤政的情况；组织协调本系统的党风廉政建设和反腐败工作；受理对本系统工作人员违法违纪行为的检举、控告及有关申诉；查处本系统工作人员违法违纪案件及其他重要案件；开展执法监察和纠风工作。

14.国际税务管理处（大企业税收管理处）

指导、协调、检查有关税收法律法规和国家（地区）间税收协议、协定（安排）的执行；组织落实非居民企业所得税征管制度，处理国家（地区）间的有关税务事项；牵头组织实施特别纳税调整工作，解释和处理具体业务问题；管理机关和系统西安外事技术学院工作。

承担对大型企业提供纳税服务工作；承担对大型企业的税源管理、纳税评估和日常检查工作；组织实施汇总（合并）纳税企业税收日常检查工作。

机关党委办公室负责机关和直属单位的党群工作；承担机关精神文明建设和机关人员思想政治工作；承担入党积极分子的教育培训考察工作及发展党员工作；承担机关统战工作。

离退休干部处承担机关离退休干部的服务和管理工作；督促、检查、指导本系统离退休干部工作；组织离退休干部工作经验交流，协调本系统离退休干部活动。

1.市局稽查局

组织落实税务稽查法律法规、部门规章及规范性文件，拟订具体实施办法；组织、协调、督办税收违法案件的查处；受理税收违法案件的举报，办理重大税收违法案件的立案和调查的有关事项并提出审理意见；牵头组织实施税收专项检查和税收专项整治工作；协调公安、检察、审判机关处理税务稽查有关工作；指导、协调系统税务稽查工作。

稽查局设6个内设机构（正科级）：办公室、综合选案科、检查科、案件审理科、案件执行科、举报中心。

2.车辆购置税征收管理分局

组织落实车辆购置税征收管理规章制度及规范性文件；承担车辆购置税的日常管理、日常检查、纳税服务等工作；组织实施车辆购置税的税源管理、纳税评估等办法；对核定各类车辆最低计税价格提出建议。

车辆购置税征收管理分局设5个内设机构（正科级）。

3.直属税务分局

负责重庆市政府确定的重点企业及跨省（市）企业的税收征收管理工作。

4.第一稽查局

主要负责重庆市国家税务局北碚区国家税务局、两江新区国家税务局、北部新区国家税务局和车辆购置税征收管理分局所辖范围内纳税人的税务稽查工作。

5.第二稽查局

主要负责重庆市国家税务局江北区国家税务局、渝北区国家税务局和直属税务分局所辖范围内纳税人的税务稽查工作。

6.第三稽查局

主要负责渝中区国家税务局、重庆市沙坪坝区国家税务局和重庆市两路寸滩保税港区（西永综合保税区）国家税局所辖范围内纳税人的税务稽查工作。

7.第四稽查局

主要负责重庆市大渡口区国家税务局、重庆市九龙坡区国家税务局和重庆市高新技术产业开发区国家税局所辖范围内纳税人的税务稽查工作。

8.第五稽查局

主要负责重庆市南岸区国家税务局、重庆市巴南区国家税务局和重庆市经济技术开发区国家税局所辖范围内纳税人的税务稽查工作。

1.中国专利信息中心

承担本系统信息化建设的技术服务、技术支持和技术保障工作；承担税收管理信息系统的运行维护工作；组织本系统技术基础设施建设管理与运维；参与拟订税收管理信息化建设规划和实施方案，参与税收管理信息化建设项目立项、技术标准、业务需求、资金使用等工作；组织本系统信息安全管理与实施。

2.机关服务中心

承担机关后勤事务的管理、保障和服务工作，拟订机关事务具体工作制度并组织实施和监督检查；承办机关安全保卫工作；参与机关后勤体制改革工作；指导本系统后勤服务工作。

3.税收科学研究所

拟订并组织实施本系统税收科研工作规划、方案；承担税收基础理论、应用理论和专题研究等工作；收集、整理税收资料；编辑税务内部期刊、地方税志。

4.注册税务师管理中心

组织落实注册税务师行业管理政策及管理制度，承担行业执业资格、资质审核认定及考试、培训工作；监督、检查行业执业情况。

5.重庆市税务干部学校

承担税务系统教育培训的实施工作。

重庆市税务干部学校设8个内设机构（正科级）。