2002年9月，
九广铁路公司提出在
黄埔区建造自动捷运系统，连接九铁红磡站。同年12月，
港铁公司建议延长观塘线至黄埔站。2003年11月，政府请求地铁公司进一步检讨观塘线延线方案，地铁公司于2004年2月提交修订建议。2005年7月，九铁公司和地铁公司提出两铁合并方案，建议以
观塘线延线取代原计划的黄埔自动捷运系统。2007年12月，两铁合并为
港铁。2008年3月，行政会议批准港铁公司对观塘线延线进行进一步规划及设计。勘探工作于2010年3月开始，工程于2011年6月2日动工。2016年10月，黄埔站正式开通运营。
黄埔站为地下三层结构，地面为车站出入口，L1层分别为东大堂及西大堂，L2层为单侧式月台。车站设计融入艺术元素，月台两端放置两幅以“历史与想象——
黄埔区”为题的大型壁画。东大堂设有客务中心，而西大堂则仅有自助客务机。两个大堂均设有商店、自助柜员机及自助售卖机。
黄埔站临近黄埔花园巴士总站，距离红磡码头也不远。位于红磡家维商场的
港铁特惠站为使用成人八达通的乘客提供
港元2元的车资折扣。