落马洲管制站位于新界元朗区落马洲，是中国香港与中国内地之间的一个重要移民管制站。它通过落马洲大桥与中国内地的皇岗口岸相连，是香港特别行政区往中国内地车辆交通的重要口岸。自2003年1月27日起，落马洲口岸全日24小时通关，是目前中国香港至中国内地唯一全日开放的陆路出入境口岸。由于COVID-19大流行，落马洲管制站曾于2020年2月4日至2023年2月6日关闭。

落马洲管制站是中国香港与中国内地之间建成的第三个道路过境点，位于万锦涌和沙头角之后。它是新界环路项目的一部分，旨在缓解拥挤的万锦涌管制站。建设始于1985年12月，由建筑署设计的海关、警察和其他建筑。新的过境点于1989年12月29日开放，最初只使用东桥，提供两条车道。西桥于1991年10月18日对交通开放，增加了两条车道。1993年10月，彭定康宣布了一项计划，将该过境点全天候开放。夜间边境过境于1994年11月4日开始实施。

中国香港与中国内地的车辆，原本只可经文锦渡往返，为舒缓深港道路交通需求，深、港两地政府在1980年代协议，由香港政府兴建落马洲管制站，连接至皇岗口岸。1989年12月29日货检通道正式通车。1991年8月8日，客运部分正式开通。口岸开放初期通关时间由每日早上9时至下午5时。由于落马洲的车辆流量较文锦渡为大，渐渐便成为中国香港与中国内地间最主要的陆路口岸，通关时间亦不断延长，2001年12月1日延长至早上6时30分至凌晨零时。为应付凌晨时分市民往返内地的需求，2003年1月27日正式实施24小时通关。

来往深港两地的货柜车一般都经过落马洲管制站往返内地，随着深港货运贸易发展，现时口岸每日皆大排长龙。遇有特别事件，例如边防电脑系统发生故障、风球除下和严重交通意外，车龙更可能沿公路伸延至上水等地。

前往中国内地的旅客，可在香港特别行政区各区乘搭跨境巴士往返内地。跨境巴士需在检查大楼停下，旅客下车接受边防检查。

旅客亦可乘搭香港各种交通工具至落马洲，再转乘皇巴士（或称“黄巴士”）进入内地。落马洲至皇岗口岸的穿梭巴士服务于1997年3月20日开始。费用每人7元。

在运输署的规范下，业界共开设六条来往皇岗口岸及香港市区的跨境巴士服务，包括：

- 24小时跨境快线

- 观塘24小时跨境快线

- 皇岗口岸 ↔ 蓝田地铁站（经创纪之城第5期apm、九龙湾地铁站）（回程加停钻石山荷里活广场）

- 油尖24小时跨境快线

- 皇岗口岸 ↔ 尖沙咀柯士甸道（香港童军中心）

- 跨境全日通

- 湾仔跨境全日通

- 湾仔←→皇岗口岸

- 旺角跨境全日通

- 旺角←→皇岗口岸

- 锦上路跨境全日通

- 九广西铁锦上路站←→皇岗口岸

- 深港直通快线

- 荃湾←→皇岗口岸

新田公共交通换乘站提供跨香港特别行政区的公共交通，主要在新界范围内，但不仅限于此。深圳皇岗口岸和新田公共交通换乘站之间有跨境班车，途经落马洲管制站。这些班车每年365天至少每15分钟一班。

- 新界44B、44B1、75、78、79S、605、616S

- 未编号服务，往返观塘（经沙田、香港中文大学、大埔、粉岭、上水）。这种不经常的服务主要作为夜间服务。

非特许巴士直接绕过新田公共交通换乘站前往目的地。

- 观塘（蓝田站）至皇岗口岸

- 荃湾（置富城）至皇岗口岸

- 佐敦（柯士甸道）至皇岗口岸

- 湾仔码头及信德集团中心至皇岗口岸

- 旺角（雅仁街）至皇岗口岸

- 锦上路站至皇岗口岸

2015年，落马洲管制站共处理了3700万人次（包括司机和乘客），成为香港特别行政区第二繁忙的道路管制站，仅次于处理4150万人次的深圳湾口岸。相比之下，附近的落马洲支线铁路口岸处理了6190万人次。