马晓川，出生于隆昌市，曾在西北工业大学宇航工程学院攻读飞行器控制、自导与仿真专业，分别于1991年和1994年获得学士和硕士学位。他在中科院声学研究所担任研究员，并在此机构内担任多个职务，包括数字系统集成技术部主任、所长助理以及副所长。此外，他还兼任多个学术组织的重要职位，如中国声学学会理事、会士，中国电子学会高级会员，水中兵器学会学术委员会委员。

- 1991年，在西北工业大学宇航工程学院获得飞行器控制、自导与仿真专业学士学位。

- 1994年，在同一学院继续深造并获得同专业的硕士学位。

- 1997年，在西北工业大学计算机系获得信息与信号处理专业博士学位。

- 1997年至1999年，马晓川在中国科学院声学研究所从事博士后研究工作。

- 1999年至2002年，加入IBM中国研究中心，担任Staff Research Member。

- 2003年起，回到中科院中国科学院声学研究所，担任数字系统集成技术部主任，并晋升为研究员。

- 2006年，开始担任中科院声学所所长助理。

- 2009年，被任命为中科院声学所副所长。

马晓川的研究领域广泛，涵盖飞行器容错控制、语音信号处理、基于网络中间件的人机交换、汉字手写识别、多媒体数据编码等多个方面。他的主要研究兴趣集中在传感器阵列优化技术、海洋混响及海洋环境的声学感知、高性能信号处理机、水下航行器设计等领域。

作为国家某重点工程的副总师，马晓川主持了多项国家级和中科院的重大项目。他曾荣获汪德昭青年学术奖、IBM实验室技术进步奖等多项荣誉。近年来，他已在国际知名期刊上发表了超过50篇学术论文，其中包括《Journal of the Acoustical Society of America》《IEEE Trans》《Letters》以及《Elsevier系列期刊》《声学学报》等刊物。

2017年5月，马晓川因其在科研领域的突出贡献获得了全国创新争先奖。