砂井总管府是中原地区元朝时期的一个行政区划单位。

砂井总管府成立于孛儿只斤·爱育黎拔力八达延祐三年（1316年）十一月，其治所在天山县以北约八十里的砂井县。这一地区大致涵盖了现今内蒙古自治区四子王旗一带。砂井总管府与其他三个行政区划——德宁路、集宁路、净州路同属于汪古部的管辖范围。然而，随着明朝的建立，砂井总管府被废除了。

砂井总管府在其存在的短暂时间里，作为元朝的地方行政机构，负责管理其所辖区域内的事务。