林恩·亚历山大·马古利斯（Margulis, Lynn Alexander, 1938-2011）是一位杰出的美国进化生物学家，以其关于细胞起源的共生理论而闻名。她的理论彻底改变了科学界对细胞进化的理解，被认为是生命史上可能最重要和最戏剧性的事件之一。马古利斯还与英国化学家詹姆斯·洛夫洛克共同发展了盖亚假说，并成为罗伯特·惠特克的五界分类的主要捍卫者和传播者。

林恩·马古利斯是家中四个女儿中最大的一个，她的父亲莫里斯·亚历山大是一名律师兼商人，母亲莱奥尼·怀斯·亚历山大是一名旅行社代理。林恩15岁时，完成了海地公园高中二年级的课程，随后参加了一个特殊的早期录取项目进入芝加哥大学学习。1957年，她毕业并获得了文科专业学位，之后在威斯康星州大学获得动物界和遗传学的理科硕士学位。1965年，她在加利福尼亚大学伯克利分校获得了博士学位。

林恩·马古利斯的研究生涯始于对细胞的繁殖现象的兴趣，特别是那些遗传物质存在于细胞质中而非细胞核内的情况。她的共生理论提出真核生物是由无核细菌共生进化而来的，这一理论最初遭到了广泛的质疑和嘲笑，但最终通过遗传证据得到了证实，并被广泛接受。她还是盖亚假说的支持者，该假说认为地球是一个统一的生命有机体。

马古利斯特别关注共生现象（symbiosis）。共生现象是一个科学术语，指的是两个不同的生物品种紧密地生活在一起，而这种生活方式至少会对其中的一种生物有利。共生现象的例子有：能够清理大鱼身上寄生虫的小鱼，或者生长在人类皮肤上的真菌。马古利斯建立了一套理论：真核生物（eukaryotic cells，即具有核的细胞）是由无核细菌共生进化而来的，而这种细菌之前是可以独立存活的。这套理论还提出，叶绿体和细胞中的其它结构——线粒体，都是从之前能够独立生活的细菌品种进化而来。同时连续内共生理论以一个全新的视角看待进化论，帮助解释了真核细胞的起源。马古利斯的观点是革命性的：即包括人体所有细胞在内的真核细胞都是由细菌进化而来的，而这些细菌在20亿年前都是在共生关系中存在的。

在20世纪60年代和70年代，马古利斯在研究她的理论时曾受到质疑，甚至遭到其他科学家的嘲笑和奚落。她继续编写了一本关于共生理论的书——《真核细胞的起源》（Origin of Eukaryotic Cells）(1970)。她在修订版《细胞进化中的共生现象》（Symbiosis in Cell Evolution）(1981)中详细阐述了这方面的工作。自那之后，马古利斯的理论得到广泛接受。

马古利斯关于生物学的整体观使她成为盖亚假说（Gaia hypothesis）支持者。盖亚假说认为，地球是一个统一的生命有机体，彼此运行、相互联系。盖亚假说是英国生物学家詹姆斯·拉伍洛克（James Lovelock）于1968年提出的。根据拉伍洛克的这个理论，所有的生物相互作用，创造了生命赖以继续存活的环境。拉伍洛克的理论在科学界引起了争议。当马古利斯帮助拉伍洛克进一步发展盖亚假说时，她自己也遭受了更多的诘难，但也有一些科学家认为对于盖亚理论的研究可以帮助人们深入了解复杂的环境问题。

2011年11月22日，林恩·马古利斯因出血性中风在家中逝世，享年73岁。她的骨灰被撒在她最喜欢的研究区域附近。

在芝加哥大学里，林恩遇到了卡尔·萨根（Carl Edward Sagan），那时萨根还是一个物理学研究生，后来成为著名的天文学家和作家。1957年马古利斯毕业，获得了文科专业学位，当年6月，和萨根（Sagan）结婚，然后他们搬到了威斯康星州（Wisconsin）的麦迪逊（Madison）居住。在那里，马古利斯于1960年获得威斯康星州大学动物界和遗传学的理科硕士学位之后，马古利斯和萨根又搬到了加利福尼亚州。

在那里，马古利斯于1965年获得了加利福尼亚大学伯克利分校的博士学位。也就在那个时期，她和萨根的婚姻走到了尽头，然后马古利斯和她的两个儿子搬到了马萨诸塞州（Massachusetts）。

从1966年到1988年，马古利斯在波士顿大学任教22年。在她的第二次婚姻中，她嫁给了托马斯·N·马古利斯（Thomas N. Margulis）——一位结晶学家。他们的婚姻始于1967年，结束于1980年。在她的第二次婚姻中，两人育有一子一女。从1988年开始，马古利斯一直在阿默斯特（Amherst）的马萨诸塞大学阿默斯特分校教植物学的发展。

马古利斯是天文学家卡尔·萨根的第一任妻子，她的子女包括：

多里昂·萨根（Dorion Sagan）：一名科普作家，和母亲合写了一些书籍。

杰里米·萨根（Jeremy Sagan）：软件设计师、萨根科技创办人。

沙克利·马古利斯-欧努马（Zachary Margulis-Ohnuma）：一名律师。

珍妮佛·马古利斯（Jennifer Margulis）：教师与作家。

马古利斯曾在全世界作过演讲，也在很多协会和委员会工作过。她曾在美国宇航行局（美国航空航天局）工作，写了很多书，也与别人合著了很多书、电影剧本以及文章等。1983年马古利斯入选美国国家科学院，同时也是俄罗斯自然科学院三位美国成员中的一员。她还获得了好几所大学的荣誉博士学位。