平云书院始建于清光绪二十三年（1897年），由时任知县陈兆棠创建于
大邑县城东南角。书院设施包括讲堂、宿舍、内院以及花园等。最初的山长是由来自成都尊经书院的学生、
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举人张文拨担任。书院招收了40名学生，每月举行两次课程，并提供奖学金。光绪二十八年（1902年），张文拨去世后，知县唐坼聘请本地拔贡刘垣和举人黄应秋分别担任正、副山长。不久，新上任的知县吴祖尧为了推广新式教育，任命尊经书院的学生、
射洪市籍人士刘光谟接替山长一职，并将考试形式从传统的八股试帖转变为策论。到了光绪三十年（1904年），平云书院被改建为县立第一高等小学堂，完成了其向现代化教育机构的转型。