《超级机器人大战 - Original Generation 2》是Banpresto公司的招牌作品，玩家将会以游戏中的角色身份登场，故事展开的激烈程度决不亚于动画原作。当然作品中刻画鲜明的人物形象，才是博得玩家以及支持者的重点。
新西元187年，也就是反对联邦政府的蒂派因·库鲁赛依达司与异星人结束“1.5战役”之后半年，地球联邦政府不得不重新编排组织，任命布赖恩·米得克力得为联邦政府大统领，之后更通过联邦会议公开了“1.5战役”的结果。会上一个被称为”东京宣言“的讲话公开承认了
地球以外有生命体存在，并威胁到人类的生命。布赖恩·米得克力希望全世界联合起来，并发表了关于
联邦军的架构改编和军备增强的“依吉司计划”，总体方针在于大量生产人形兵器，并强化地球防卫能力。为此许多势力都开始蠢蠢欲动，地球眼见即将陷入一片混乱之中。