兰州大学第二医院（兰州大学第二临床医学院）有3个院区，其中主院区位于甘肃省兰州市城关区萃英门82号，始建于1928年，占地面积155亩，建筑面积约40.1万平方米，是一所三级甲等综合性医院，是甘肃省、兰州市医保和新型农村合作医疗定点医院，是卫生部脑卒中筛查与防治工程基地、卫生部腹膜透析中心、中华医学会外科分会腹腔镜内镜诊疗技术培训基地、中华医学会外科分会消化内镜诊疗技术培训基地、卫生部耳鼻咽喉科内镜诊疗技术培训基地、卫生部初级创伤培训基地。

1928年，医院前身-兰州中山医院在南关街创建。

1932年，医院成为兰州大学附属中山医院。

1936年，医院并入甘肃省立兰州医院。

1948年，医院更名为国立兰州大学医学院附设医院。

1949年，医院更名为兰州大学医学院附设医院。

1959年，医院从兰州大学分出独立建院，更名为兰州医学院第二附属医院。

2004年，医院随兰州大学医学院整体并入兰州大学，更名为兰州大学第二医院。

2018年12月4日，医院被国家卫健委公布为首批肿瘤多学科诊疗试点医院。

医院开放床位3500张，配有Pet-CT、容积旋转调强(VMAT-ElektaSynergy™)医用直线加速器、飞利浦放疗专用大孔径4D-CT模拟定位机(Brilliance CT Big Bore)、-192高剂量率近距离治疗机、医科达-Monaco和飞利浦-Pinnacle3治疗计划系统、医科达肿瘤信息网络系统(Mosaiq)、德国激光定位灯LAP(DORADO4)、德国PTW三维水箱、瑞典ScandiDos公司实时剂量四维验证系统(Delta4)、二维矩阵验证系统、3.0T核磁共振、128排螺旋CT、宝石CT、移动CT、ECT、数字胃肠机、体外震波碎石机、3D腹腔镜、数字减影血管造影机、彩色多普勒超声检查仪、大型自动化生化仪、一体化手术间、流式细胞仪、基因测序仪、全自动质谱分析仪、全自动片剂摆药机、神经外科立体定向系统、椎间孔镜、超声内镜、数字乳腺机、准分子激光仪等医疗设施。

医院设有心血管内科、神经内科、呼吸内科、消化内科、肾病内科、血液科、心理卫生科、全科医学科、老年病科、内分泌代谢科、风湿免疫科、肝病科、疼痛科、感染科、中医科、普通外科、神经外科、泌尿外科、心脏外一科、心脏外二科、心脏外科CICU、骨科、胸外科、血管外科、整形科、烧伤矫形科、体外循环科、康复医学科、肿瘤内科、肿瘤外科、放疗科、伽马刀治疗科、介入科、妇科学、产科学、生殖医学科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、皮肤科、儿童医院、急救中心、重症医学科、麻醉科、手术室、检验医学中心、放射影像科、核磁共振科、核医学科、病理科、超声医学中心、临床输血科、功能检查科、内镜中心、临床药学部等临床科室和医技科室。

2021年4月19日，兰州大学第二医院护理部被中华全国总工会授予“全国国际劳动节巾帼标兵岗”荣誉称号。

2023年5月，《2022届中国顶级医院100强》名单发布，兰州大学第二医院排名第86位。

2023年10月，兰州大学第二医院入选2024-2028年度甘肃省科普教育基地名单。