国立北平市研究院是1929年9月9日中国国民政府在北平（今北京市）成立的学术研究机构。1927年中国国民党中央政治会议议决设立国立中央研究院时，筹备委员李石曾提议同时设立局部或地方性的研究机构 。 国民政府 1928 年 9月 通过李煜瀛所提议案 ，1929 年5月成立筹备委员会 ，任李煜瀛为筹委会主任，蔡元培、张静江为筹备委员 。同年8月 ，行政院决议以北平大学的研究机构为基础组建国立北平研究院，并于9月9日宣布正式成立，由李煜瀛任院长。

1929年9月9日国民政府在北平市(今北京市)成立的学术研究机构。1927年中国国民党中央政治会议议决设立国立中央研究院时﹐筹备委员李石曾提议同时设立局部或地方性的研究机构。国民政府1928年 9月通过李煜瀛所提议案﹐1929年5月成立筹备委员会﹐任李煜瀛为筹委会主任﹐蔡元培﹑张静江为筹备员。同年 8月﹐行政院决议以北平大学的研究机构为基础组建国立北平研究院﹐并于9月9日宣布正式成立﹐由李煜瀛任院长。

北平研究院隶属于教育部﹐下分行政事务与研究机构两部分。行政事务设总办事处﹐处理全院行政事务。研究机构分物理化学﹑生物﹑人地三部﹐设物理﹑化学﹑镭学(后改称原子学)﹑药物﹑生理﹑动物﹑植物﹑地质﹑历史等九个研究所和测绘学事务所。除药物﹑镭学两研究所设于上海市外﹐其余各所均设在北平市。各研究所设所长一人﹐由专任研究员兼任﹐另有研究员﹑副研究员﹑助理研究员﹑助理员﹑练习生各若干人﹐并聘所外专家为名誉研究员﹑通讯研究员及特约研究员。

1937年 7月抗日战争爆发后﹐李书华于1938年在昆明成立北平研究院总办事处﹐遂将物理﹑化学﹑生理﹑药物﹑动物﹑植物﹑地质﹑历史八个研究所迁至昆明﹐继续开展研究工作。抗战胜利后﹐除生理所暂设上海外﹐其余各所均迁返北平。1949年10月﹐北平研究院为中华人民共和国中国科学院接管。