清华大学医学院（英文：School of Medicine, Tsinghua University），是清华大学直属的一个学院。学院位于清华大学内西北门往南100米医学科学楼，是中国首批卓越医生教育培养计划项目试点高校，高水平公共卫生学院建设高校之一。

清华大学医学院成立于2001年10月25日，首任院长为著名医学科学家、两院院士吴阶平。2003年组建了生命科学与医学研究院，同年4月，原隶属信息产业部的酒仙桥医院和玉泉医院正式划转到清华大学医学院。2004年4月，华信医院和玉泉医院更名为清华大学第一附属医院和清华大学玉泉医院。2012年11月，清华大学医学院成立基础医学系、药学系。两年后，清华大学医学院附属医院北京清华长庚医院开业。2017年3月，清华大学临床医学院成立。2021年10月，临床医学博士专业学位授权点正式获批。

截至2024年2月，学院设有基础医学系、生物医学工程系和临床医学院3个院系，附属医院4所，开设2个本科专业，2个一级学科博士授权点，3个一级学科硕士授权点，1个专业硕士学位授权类别，1个专业博士学位授权类别，涵盖了基础医学、生医工程和临床医学三个一级学科，其中有4个ESI全球排名前1%的研究方向。

1999年6月10日学校成立“清华大学医学科学研究中心”，为建立清华大学医学院做必要的准备。2001年10月26日，清华大学医学院宣告成立。生物医学工程学科整体划入医学院，并成立生物医学工程系。著名医学科学家、两院院士吴阶平先生担任首任院长。同年获批试办八年制医学教育。

2002年，在教育部和卫生部的共同指导下，清华大学医学院与中国协和医科大学建立了合作共建关系。2003年，清华大学医学院组建了生命科学与医学研究院；同年4月，原隶属信息产业部的酒仙桥医院和玉泉医院正式划转到清华大学医学院。同年，生物医学工程系入选一级学科国家重点学科。

2004年4月，华信医院和玉泉医院更名为清华大学第一附属医院（华信医院）和清华大学玉泉医院（玉泉医院）。2006年12月22日，教育部同意中国协和医科大学更名为北京协和医学院，使用“北京协和医学院（清华大学医学部）”的名称。

2012年11月10日，清华大学医学院成立基础医学系、药学系。2014年11月28日，清华大学与北京市共建共管的北京清华长庚医院开业，成为清华大学医学院的附属医院。2016年12月21日，清华大学决定在清华大学医学院下成立临床医学院，与医学院现有的基础医学、生物医学工程、公共健康学科等，共同构成清华医学学科的完整体系。2017年3月4日，清华大学临床医学院成立。

2017年9月20日，清华大学生物医学工程专业入选教育部“双一流”建设学科。10月10日，朝阳区与清华大学签署《朝阳区人民政府清华大学全面合作框架协议》，北京市垂杨柳医院授牌“清华大学附属垂杨柳医院”。2021年10月，清华大学临床医学博士专业学位授权点正式获批。

截至2024年2月，清华大学医学院有基础医学系、生物医学工程系、临床医学院。开设本科专业2个：临床医学八年制和生物医学工程。

截至2024年2月，清华大学医学院有专职教师83人，其中教研系列56人，教学系列8人，研究系列19人。有4名院士（分别是免疫专家董晨院士，肝胆外科专家董家鸿院士，生物芯片专家程京院士、病毒结构生物学专家饶子和院士）及多名千人教授、长江特聘教授、杰青、青千等各类人才。

截至2024年2月，清华大学医学院有基础医学（包括免疫学、肿瘤生物学、微生物与传染病学、神经科学、分子与生物学等方向）、生医工程（包括医学影像学、神经工程、微纳与组织工程等方向）和临床医学三个一级学科。国家双一流建设学科：生物医学工程；国家一级重点学科：生物医学工程。其中基础医学学科的免疫学、微生物与传染病学、神经科学、分子与生物学四个研究方向的ESI全球排名前1%。清华大学医学院有2个一级学科博士授权点，3个一级学科硕士授权点，1个专业硕士学位授权类别，1个专业博士学位授权类别。

截至2024年2月，清华大学医学院引进大批国际优秀资深教授和青年研究员，与国际顶尖医学院和研究院合作，共同追求医学前沿的突破，提升了中国医学学术与教学在世界的影响力。医学院与墨尔本大学医学院、匹兹堡大学医学院、康奈尔医学院、麻省理工学院（MIT）麦戈文脑科学研究院、约翰霍普金斯大学、华盛顿大学、加利福尼亚大学伯克利分院等世界顶尖医学学府与研究院建立合作伙伴关系，在MD/PhD教育、博士后培养、学术交流、课题研究等领域展开广泛的合作。

医院合作方面，截至2024年2月，清华大学医学院已经与山东省立医院、中国科学技术大学附属第一医院、新疆维吾尔自治区人民医院、宁夏医科大学总医院、江苏省苏北人民医院、延边大学附属医院建立了转化医学联盟，促进转化医学发展与人才培养。除了华信医院、第二附属医院、北京清华长庚医院、清华大学附属垂杨柳医院之外，清华大学与北京协和医院、北京积水潭医院、中国人民解放军总医院（301医院）、台湾长庚纪念医院、北京神经外科研究所（天坛医院神经外科）和北京医院、中日友好医院开展教学合作，培养具有临床扎实功底的优秀医生与研究员。

截至2024年2月，学员先后建立了9个研究中心及实验室。

截至2024年2月，学院拥有12个科研平台。

2020年度，清华大学医学院在研项目840项，同比增加22.4%，实到科研经费2.2亿余元，同比增长51.4%。新增项目110项，同比增加20.8%，新增项目经费总额约2.28亿，同比增长68.9%。2020年度共发表以清华大学医学院为第一作者/通讯作者单位的SCI/EI论文共计243篇，其中发表国际顶级期刊CNS（Cell/Nature/Science）共17篇，其中Science4篇，Cell3篇，Nature10篇。

清华大学医学院院徽由紫荆、蛇杖和一面盾牌组成，紫荆花代表了清华大学优秀的传承文化；单蛇之杖和盾牌是现代医学的象征， 代表了医学院人在医学之路上开拓创新的精神以及守护人类健康的决心。

清华大学医学院位于清华大学内西北门往南100米医学科学楼，医学院致力于培养既掌握临床技能又具备科研能力，能在医学领域从事研究、医疗服务、教学管理、技术创新的医学科学家、高级临床医生、医学教育工作者和大健康产业技术创新人才。截至2024年2月，清华大学医学院下设11个委员会，有附属医院4家，教学医院6家。