自1999年起，高明章担任西安建筑科技大学党委书记期间，提出了“提高教育教学质量求生存、狠抓科学建设上水平，适度扩大规模求效益，改革内部管理体制求发展”的发展战略。在他的领导下，学校启动并推进了多项重要建设项目，包括“校园建设工程”、“教学质量工程”、“学科建设工程”和“创新工程”。这些举措显著提升了学校的教学质量和科研能力，使得本科生招生人数翻倍，研究生招生增长六倍，博士授权点数量也从四个增至十个。此外，他还致力于加强党风廉政建设，制定并落实相关规章制度，确保学校工作的规范化和透明化。
高明章因其在教育领域的贡献获得了多项表彰。2000年12月，他被
陕西省教育工委、陕西省教育工会授予“全心全意依靠教职工办学优秀党政领导干部”称号。2004年，他又被评为“廉勤兼优领导干部”。