奥尻郡（
日语：奥尻郡／おくしりぐん Okushiri gun）是位于日本北海道桧山振兴局西部外海的一个郡，主要由
奥尻岛组成。郡名源自阿伊努语的“i-kus-ta-mosir”或“i-kus-un-sir”，意思是“对面的岛屿”。截至2004年，奥尻郡的人口为3,708人，人口密度为每平方公里25.93人，总面积为142.98平方公里。
奥尻郡的历史可以追溯到1869年8月15日，当时
北海道设置了11国86郡，后志国奥尻郡便是其中之一。1897年11月，北海道实施支厅制，奥尻郡下辖铃悬村、赤石村、青苗村、药师村共4个村。1906年4月1日，这四个村合并为奥尻村，并成为北海道二级村。1943年6月1日，北海道一级二级町村制废止，奥尻村改为
内务省指定村。1946年10月5日，指定町村制废止。1966年1月1日，奥尻村改制为奥尻町。