中国大熊猫保护研究中心成立于1983年（China Conservation and Research Center for Giant Panda），是在卧龙国家级自然保护区下属的原中国保护大熊猫研究中心基础上成立的国家林业和草原局直属事业单位。

该研究中心内设15个处室和卧龙神树坪、卧龙核桃坪、都江堰、雅安市4个基地。科研的主要职能是为了开展大熊猫野外生态与种群动态研究，主要负责大熊猫人工饲养、繁育等相关工作的研究与开发，承担着全国大熊猫及其栖息地珍稀野生动物遗传资源管理以及基因库建设，指导和开展大熊猫及其栖息地珍稀野生动物救护工作以及野生动植物的保护研究；承担了国内外大熊猫合作交流平台建设；推动了大熊猫文化建设宣传工作2021年11月，荣获第十届 “母亲河奖”绿色团队奖中国大熊猫保护研究中心不仅在攻克大熊猫人工繁育等方面取得重大突破，还在人工繁育大熊猫野化放归以及大熊猫野外引种等方面取得重大成效。

1980年，达成在卧龙国家级自然保护区建立“中国保护大熊猫研究中心”的协议，1983年研究中心正式建成并投入使用，通过多年努力，研究中心在大熊猫繁育、科研等相关领域取得了丰硕的成果，拥有了全球最大的圈养大熊猫种群。

2013年，国家林业局正式发文成立“中国大熊猫保护研究中心”。进一步推动大熊猫保护法制建设，并开展新一轮大熊猫保护工程建设。

2015年12月28日，中国大熊猫保护研究中心在四川卧龙大熊猫基地内正式挂牌成立，国家林业局副局长陈凤学、四川省人民政府副秘书长赵学谦共同出席并为新的研究中心揭牌，首任主任由国家林业局副局长陈凤学兼任。

2019年1月15日，四川省大熊猫科学研究院和大熊猫学院挂牌成立。如今，四川已基本形成中国大熊猫保护研究中心、成都大熊猫繁育研究基地两大科研机构为主的大熊猫科研体系。而放眼全国，三大大熊猫科研机构中，四川有其二，另一个为陕西省秦岭大熊猫繁育研究中心。

2022年3月3日，从中国大熊猫保护研究中心获悉，中国大熊猫保护研究中心2022年大熊猫繁殖工作在该中心神树坪基地繁育园正式启动，工作人员们早已做好充分准备，为大熊猫安排一场春天的约会今年的大熊猫繁殖工作，熊猫中心今年更加注重大熊猫的优生优育，以高质量的繁育为核心目标。

2022年9月2日，大熊猫保护研究中心北京基地预计年底开工，力争2024年底全面运营。北京基地生态环境优越，对大熊猫“迁地保护”，能有效扩大大熊猫生活空间，创造更好的动物福利。

2023年5月9日，国家林业和草原局与腾讯控股签署战略合作协议，双方将联合中国大熊猫保护研究中心，采用高拟真3D生物还原、云端实时渲染等数字科技，研发全球首只“高拟真数字大熊猫”。运用腾讯人工智能、云计算、大数据等下一代互联网技术打造“数字工具箱”，在智能监测等方面助力国家公园旗舰物种的保护与研究。

2008年地震发生时，地震中与卧龙国家级自然保护区直线距离只有几公里。“熊猫家园”遭到重创，饲养员们冒着余震风险“生死狂奔”转移大熊猫，包括6只受孕大熊猫在内的53只大熊猫以及被转移到了雅安碧峰峡基地。2008年6月26日5·12汶川地震后我国首个大熊猫终生认养仪式26日在重庆市举行，同时标志着卧龙大熊猫基地灾后重建援助工程已经全面启动。受地震的影响，卧龙大熊猫基地32套大熊猫圈舍中有14套全部损毁，地震前圈养的63只大熊猫中，一只死亡、一只失踪，其余大熊猫已经陆续转移到北京、雅安碧峰峡、广州市、福州市、昆明市等地。

2008年5月12日四川省发生大地震后，卧龙国家级自然保护区管理局的职工在第一时间将大熊猫转移到安全地带。此次地震，致使大熊猫栖息地遭受重创，有49个大熊猫自然保护区不同程度受损，八十万亩大熊猫栖息地彻底损坏。特大地震灾害引起的山体滑坡以及森林大面积的损毁，对大熊猫野生种群构成了严重威胁。在5·12汶川地震中，中国保护大熊猫研究中心卧龙基地遭受重创，32套大熊猫圈舍被毁，60多只大熊猫被迫分批转移。

2008年5.12汶川大地震后，大熊猫家园在重建的过程中，各级林业部门和保护单位充分利用好灾后重建的契机，加快大熊猫走廊带的重构，这一重构对促进大熊猫种群间的基因交换以及种群的发展壮大意义深远。研究中心着眼于大熊猫科研保护事业未来发展需求，决定重新进行了定位、规划和建设。目前研究中心下辖的卧龙、都江堰市和雅安市三个基地已经全部完成重建或改造并投入使用。新的研究中心设计有饲养圈舍30套，繁殖圈舍20套，科研试验室1座，兽医院1座，大熊猫保护培训与环境教育中心1座。小型野化培训场10个，总面积约30万平方米；中型野化培训场10个，总面积约200万至300万平方米；大型野化培训场3个，总面积约300万平方米，圈养大熊猫食用竹面积275.6公顷。

2012年10月30日首批18只大熊猫从研究中心碧峰峡基地重返卧龙国家级自然保护区，这是5·12汶川地震后，首批大熊猫返回卧龙的重建基地。有经历过2008年“5·12”地震、送到其他动物园寄养的，有震后在碧峰峡基地安置的，也有震后在碧峰峡基地出生的大熊猫。为庆祝这18只大熊猫入住，卧龙自然保护区管理局在卧龙重建基地举行了一场隆重的欢迎仪式。

2014年3月31日，汶川地震时送到昆明市寄养的大熊猫美茜返回雅安碧峰峡大熊猫繁殖基地。

“地震对野生大熊猫的最大影响，不是直接导致其死亡，而是严重破坏熊猫种群的繁衍生息环境。”张和民说。“5·12汶川地震对四川大熊猫栖息地造成了严重破坏，由于低海拔地区竹子大量死亡，大熊猫会面临食物短缺等生存挑战，这个冬天不能排除有更多野生大熊猫生病甚至死亡。”

多年以来，在国家林业和草原局的共同领导下，熊猫中心始终践行初心使命、开拓创新、砥砺奋进，在大熊猫保护研究领域取得了突出成就。

成功攻克圈养大熊猫繁殖发情难、配种受孕难和育幼成活难三大难关，并获得国家科技进步二等奖。圈养大熊猫种群数量从最初的6只发展到356只，成功创建世界最大的大熊猫人工圈养种群。并且通过加强谱系管理等一系列优生优育技术，实现了通过数量优先转到质量优先的转变和可持续发展，奠定了大熊猫学科研究、野化放归、合作交流等大熊猫保护研究工作基础，为提升大熊猫保护管理水平作出了积极贡献。

正式启动人工繁育大熊猫野化培训放归研究，进一步推进了大熊猫野化培训以及放归、监测等关键技术。并成功野化放归人工繁育大熊猫9只，首次实现复壮野外濒危小种群以及人工繁育大熊猫在自然栖息地生存的重要目标。该项研究成功获得第十届梁希林业科学技术奖科技进步奖一等奖，入选“2019年度中国生态环境十大科技进展”。

将5只经过培训的圈养雌性大熊猫放归野外参与引种，其中2只先后产下幼仔8只，存活7只。该项研究成功破解了圈养大熊猫种群基因不足等难题，为野生濒危小种群遗传资源保存以及野外小种群复壮及历史分布区重引入做出重要贡献。

与境外16个国家（地区）的18家动物园以及境内39家动物饲养机构、10余家科研院所开展合作交流，搭建了全球最大、合作最广的大熊猫合作交流平台。国家主席习近平出席比利时天堂公园、俄罗斯莫斯科动物园的大熊猫馆开馆仪式，与比利时、荷兰两国元首就合作交流大熊猫产仔互致贺信，圆满完成包括德国总统、奥地利总统总理等100多个国家（地区）政要来访外事接待任务。提高了公众保护意识，推动了共享生态文明建设和生态多样性保护成果，促进了国内国际人文交流提供“中国方案”。

实施“熊猫中国”文化品牌战略，强化宣传阵地建设，开展科普研学、公益宣传等工作，形成了大熊猫文化建设及科普教育宣传工作的良好发展态势。上线官方新浪微博、微信公众平台等一系列新媒体平台，推动10余部纪录片专题新闻片在中国中央电视台、新华社等官方平台播出。大力弘扬了大熊猫文化，宣传了中原地区生物多样性保护成就，为世界生物多样性保护提供了“中国答案”。

拓展生物多样性保护研究领域，建立起“大熊猫国家公园珍稀动物保护生物学国家林业和草原局重点实验室”“邛崃山濒危野生动植物保护生物学国家长期科研基地”“岷山濒危野生动植物保护生物学国家长期科研基地”和“大相岭濒危野生动植物保护生物学国家长期科研基地”。组织开展起主食竹等41项课题研究，共发表论文700余篇，出版专著10部，荣获国家和省部级科技进步奖10次，荣获国家专利40余项，制定行业标准3项。为大熊猫保护事业发展奠定了牢固基础，为建设美丽中国、生物多样性保护以及国家公园体制试点和国际人文交流作出了重要贡献。

2016年5月11日，中国保护大熊猫研究中心卧龙神树坪基地“中华大熊猫苑”开园，总建筑面积达到19844.51平方米，项目资金由香港特区政府援助。项目总投资大约22174万元，于2011年4月开工，2014年12月竣工基地分为大熊猫饲养、野化培训和野生动物公众教育3大功能区，具备着59套大熊猫圈舍、集大熊猫饲养、繁育等培训工作及公众教育和高端科学观察为一体的世界一流大熊猫研究中心。

2010年，中国大熊猫保护研究中心卧龙核桃坪野化培训基地正式建立，采用着“母兽带仔”野化培训方式，研究人员把具有丰富带仔经验的受孕大熊猫放在自然环境培训圈内产仔，幼仔从出生即跟随母亲一起成长、学习。

在5·125·12汶川地震中，中国大熊猫保护研究中心大熊猫圈舍、科研设施等损毁严重。为了能够更好地保护大熊猫，在香港特区政府的援建下，四川省有关部门把地址选在都江堰，建造起一个集大熊猫养老、救护与疾病防控于一体的保护机构。四川省有一些上了年纪或在其他地方受伤的熊猫，都会被送到这里来调理、治疗，很多老年大熊猫都曾经或正在这里安享晚年。

2002年4月，该基地首期建设正式开工，占地1071亩，于2003年9月竣工，总共建成大熊猫标准兽舍十六套、科研中心、育幼中心等相关设施。自此，世界上首次大规模的大熊猫迁移计划正式开始实施，从阿坝藏族羌族自治州境内的卧龙中国保护大熊猫研究中心前后两次迁出十四只大熊猫送来新家，加上从宝兴县、白水江等地迁入的六只大熊猫，碧峰峡基地的初始圈养种群总共达到了二十只。国家林业局副局长赵学敏在开园仪式上表示，将这里逐步成为国际一流的科学研究基地、保护基地和宣传教育基地

2022年9月19日凌晨，大熊猫秦岭亚种研究中心大熊猫“安安”诞下一只雌性幼崽，体重132.8克，发育良好，这是大熊猫“安安”首次生产。截至到目前，秦岭大熊猫研究中心今年一共成功繁育5只大熊猫幼仔，秦岭大熊猫人工种群数量达到了41只。充分证明了我国秦岭大熊猫研究中心近年来人工饲养繁育技术体系发展逐渐走向成熟。

2011年8月21日，6只在国外出生并归国的大熊猫，在中国保护大熊猫研究中心碧峰峡基地度过了归国后的第一个集体生日。国内外的上千名游客和爱心人士冒着瓢泼大雨，为“国宝”送上生日祝福。庆典过后，志愿者代表将6个熊猫蛋糕分别抬进他们的圈舍，供它们享用。“国宝”们对蛋糕非常的喜爱，纷纷闻香而来，尤其是“大熊猫美生”，一出圈就迫不及待地享受着志愿者准备的美食。

2021年8月18日是大熊猫“青青”6岁生日，中国大熊猫保护研究中心都江堰青城山基地管理处为大熊猫“青青”举办了一场简单而温馨的生日会。基地双楠园饲养师们一大早便精心为青青装置了生日现场，为“青青”准备了一份美味的生日大餐。10点30分，“青青”从圈舍中走出，闻一闻饲养员准备的胡萝卜、吃起了大红苹果，吃累了又抱着心爱的木屑抱枕玩耍嬉戏，惬意的享受着自己生日惊喜。

2022年8月19日，在四川阿坝，中国大熊猫保护研究中心卧龙神树坪基地举办大熊猫生日会，三个家庭9只熊猫滚滚相继亮相，在活动现场，工作人员们为这些刚满周岁的熊猫宝宝们精心准备了冰淇淋蛋糕、竹子和各种新鲜水果给熊猫宝宝使用。

2021年11月，中国大熊猫保护研究中心圈养大熊猫野化培训团队荣获第十届 “母亲河奖”绿色团队奖。

2024年3月23日，雌性大熊猫“青糍”因患罕见肠梗阻并发肠套叠，病情危重，抢救无效死亡。“青糍”是2022年6月21日出生于熊猫中心卧龙核桃坪基地。自2024年3月2日“青糍”发病以来，中国大熊猫保护研究中心多次联合四川大学华西医学中心等医院会诊，3月5日成功完成了肠梗阻手术。恢复过程中，“青糍”又突发肠套叠并引发二次梗阻，于3月17日进行了急诊手术，坏死肠段被顺利切除。随后，虽专家团队每天24小时精心护理，但仍未能挽留住“青糍”的生命。大熊猫肠套叠是比肠梗阻更为凶险的急腹症，是部分肠管及其肠系膜套入与其相连的肠腔内，导致肠内容物通过障碍，极易引起肠穿孔、肠坏死、腹膜炎，甚至休克，抢救时间非常短暂。“青糍”病情是熊猫中心近年来发现和经历的首个大熊猫肠梗阻并发肠套叠病例。

2024年5月24日，中国大熊猫保护研究中心在社交媒体的评论区回复网友关于福宝被偷拍的问题，表示关于网络流传的“福宝”图片一事确定为偷拍者所为，大熊猫保护研究中心基地已经报警，待有调查结果后，中国大熊猫保护研究中心会公布出来。

2024年6月13日，中国大熊猫保护研究中心针对大熊猫被虐待等不实信息做出回应。近期十余名人员在熊猫中心都江堰基地、神树坪基地传播大熊猫被虐待等不实信息，散发扇子等物料并故意倒地误导不知情公众，现场联系媒体、境外自媒体扩散不实信息抹黑大熊猫饲养管理、科研合作及保护工作。涉事人员的行为已严重扰乱游览秩序，严重干扰熊猫中心正常工作，严重抹黑熊猫中心形象。部分人员甚至在园区尾随、跟拍、辱骂熊猫中心熊猫专家，将其肖像上传至网络制造网暴事件，对熊猫专家造成严重身心伤害，并已影响到专家的正常生活和工作。对于涉事人员的极端言行，熊猫中心已第一时间报警。对于线下干扰熊猫中心正常工作，骚扰熊猫中心工作人员，在各基地传播不实信息、违规直播的人员，都将列入终身禁止进入熊猫中心各基地参观名单。

在1999年，大熊猫“安安”“佳佳”抵达海洋公园，两只大熊猫均为高寿离世，其在香港期间深受香港市民喜爱，深化了香港与内地的血脉联系。2007年，中国大熊猫保护研究中心的又一对大熊猫“大熊猫乐乐”“盈盈”定居香港海洋公园，持续深化了大熊猫保护合作，建立起了深厚的合作情谊，促进了人文交流。2024年7月2日，中国大熊猫保护研究中心称：在香港回归祖国27周年之际，来自中国大熊猫保护研究中心的一对大熊猫会在2024年前往香港定居。这也是香港特别行政区迎来的第三对大熊猫。