黄渡站始建于1905年。1990年,黄渡铁路立交桥建成,连接
南翔站下行到达场;2004年,借道该铁路桥修建了往沪昆铁路封浜站的黄封联络线。2014年,
沪苏通铁路方案调整,原终到站
安亭站经本站延伸至
封浜站,并计划修建黄封复线。2019年4月26日,新信号楼启用,其他相关线路工程于2020年4月13日全部完工。
黄渡站目前不办理客运业务,专注于货运服务。车站办理整车、集装箱发到业务,涉及的货品包括路料、轨枕、饲料、轿车等。此外,站内还设有专用线路,分别通往上海铁路局上海大型养路机械运用检修段和国家物资储备局上海七处,以满足特定物流需求。