全书共计五卷，即：《
科学认识论，第一卷：导论》、《科学认识论，第二卷：科学认识发生论》、《科学认识论，第三卷：科学认识形成论》、《科学认识论，第四卷：科学认识发展论》、《科学认识论，第五卷：科学认识价值论》。已出板前三卷。
作者认为，《自然辩证法原理》(1984)已从一个视角考察了有关科学认识的某些侧面，但毕竟不同于科学认识专题研究。随着科学认识论的学科建设的条件日趋成熟——哲学上的马克思主义哲学提供了指导思想及科学哲学提出了问题、论点等；科学上，自然科学本身提供的条件及交又科学或综合性科学提供的手段、思想、线索等，必须研究科学认识论的问题，这是时代的要求。
《科学认识论》第一卷的主要注意力放在一般哲学的高层次研究，以便为研究科学认识论提供·一些必要理论前提。作者认为，不管哲学家对科学认识有多少不同的看法，不论按朋哪一种解释来理解，科学认识都与通常说的认识论密切相关，它们彼此互相促进。科学认识论是认识论的新标志。这个命题包含丰富的内容，并且意味深长。另一方面，研究科学认识一定要以一般的认识论思想为逻辑前提和研究的基础；而正确的认识论观点，包括其中的正确的哲学原则，就为科学认识论的学科建设和发展所必需。本卷就是对这两个方面力口以论证和说明的。关于第一个论点，作者从研究万式或认识方式来考察，着眼于从新的认识方式和优越的队识方式来说明。关于第二个论点，选择了哲学中某些
原则性的问题，比如认识和实践、思维活动和物质活动等，从唯物辩证法和逻辑上对有关它们的解答提出要求。对这些原则问题的观点指导着我们如何研究科学认识论。所以第一卷是全书的指导理论，以后各卷中如果有分歧看法，应回到第一卷来辩证才能消除。全卷除绪论外，共分12章，依次是科学认识的特征，科学认识论的历史考察、现代自然科学的哲学精神、概括科学成果的方法论、坚持溯本求源的原则、彻底贯彻对立统一思想、主体和客体的层次性、主体和客体的同时性、科学认识论基本问题、认识和实践的关系。思维活动和物质运动的关系、科学认识论展望。
《科学认识论》第二卷集中研秃科学认识的发生。作者认为，这一方面是历史研究所必需的；另一方面则因为忽视关于起源问题的研究不可避免地要引起混乱人类是否生而就有科学认识？人类认识的产生与科学认识的出现是否是同时的、同步的?……从发生论的角度来看，’这些问题上的是非是较易分辨的。在研究科学认识发生的时候，关键性问题是：明确对象，区别系统发生与个体发生，并且把握它们二者的联系。所谓科学认识的发生，包括系统发生和个体发生，前者指从疫有科学认识到有了科学认识的过程，而不限制其实际内容是哪一种科学认识。科学认识的个体发生则指这一种或那一种认识是怎样从无到有的。显然二者分别属于不同等级，不可以相互代替。例如，科学认识作为一个系统，其发生在人类认识史—亡是一次性的，不可重复的。科学认识的个体发生则不是这样，存在有多少科学认识就有多少次发生过程。在人类史上科学认识发生的真正标志只能是其系统发生。当然，系统发生也不能脱离个体发生而存在。本卷共分13章，论述了前科学时期的认识主体、认识工具、认识活动、科学认识发生的背景、标志、特点及科学认识的系统发生，个体发生对科学认识发生起作用的因素、核心、途径、程度、意义等。《科学认识论》第三卷讲述科学认识的形成。作者认为，科学认识的形成是靠科学研究的成果来体现，通苎“成果”的取得使科学认识的形成过举和特点具体化，科：尝认识的首要标志是科学认识的真理性，科学认识的形成过程首要的是它的“真”特性的形成过程。所以，本卷把科学与真理的关系以及有关真理问题放在本卷的中心地位，作者认勾。科：沪认识的具体体现有多种形式，如科学事实、科学宅律、科学理论等，它们对科学认识的形成具有的意义并不等同。其中科学理论是科学论识成果的基本单元，因为只有达到这种成果形式才具有典型代表性，才能基本上表现出科学这种特殊认识的主要特征。同时，科学认识的成果的多种形式对科学认识真理性的形成也具有不同的意义。因为科学认识的形成首要的是它的真理性的形成。于是，科学认识“真”的特性的形成过程主要的是科学理论真理性的形成过程。而科学与真理的关系，就以科学理论与真理关系为代表。总之，本篇在科学认识形成的问题上，是以科学认识的成果串线，中心在于探索真理。本卷共分15章。依次是科学事实、概念、定律、理论、学科、语言，认识形成的主要规律、认识的检验、认识的证实、认识的可接受性、认识的社会承认、认识的评价、认识形成论的意义等。