电视动画《青年怪医黑杰克》是根据漫画家
手冢治虫的作品《怪医黑杰克》改编而成的前传故事，讲述了主人公黑杰克的学生时代的经历。这部作品的消息最初是在《Young Champion》杂志2015年第11期上公布的，并计划于同年秋季开始播放。
故事发生在社会动荡不安的年代，
日本正处于高速发展的阶段，同时也面临着许多挑战。1968年，
东京大学发生了重大事件，这一事件引发了许多年轻人的反抗运动。在这个背景下，有一个名叫间黑男的年轻人，他选择了一条与众不同的道路，专注于拯救生命的工作。这个未来被称为“Black Jack”的人物，将在他的青春岁月里展开一系列的冒险。
黑杰克是黑杰克的年轻版本，拥有黑白相间的发型，身上布满了伤疤。他在童年时期的一次事故中失去了母亲，自己也遭受了严重的伤害。经过医生
本间丈太郎的治疗和大量的皮肤移植，他奇迹般地幸存下来。为了纪念一位给予他鼓励和支持的黑人朋友，他决定成为一名医生，并发誓要为母亲的去世复仇。1986年，他在一所大学的医学院实习期间，展现了他对医学的热情和天赋。
冈本舞子是一名与间黑男同校的实习生，她主要负责一些日常事务。在一次紧急情况下，她与
黑杰克共同完成了对一个小男孩的手术。