卢仲佃（1521年—1587年），字汝田，号怀莘，浙江金华府东阳县人，民籍，明朝政治人物。壬子科（1552年）浙江省乡试第二十五名。嘉靖三十五年（1556年）丙辰科第三甲第三十六名进士。历任晋江市县知县、福安市知县、刑部主事、兵部员外郎中、四川成都府知府、广东按察司副使、湖广副使、江西省左参政、云南省按察使、广西壮族自治区右布政使等职。

嘉靖三十一年（1552）中举，三十五年（1556）进士。知晋江县，请筑安平石城，民以其城匾曰“卢侯城”。

任晋江令，节减民费，减免杂税。时倭寇为患，安海号称大镇，民数十万皆沿海而居，仲佃建议在安海筑城，拆废寺桥筑城，居民凭城拒守，得无恙。军饷缺乏，上级建议加征税收，卢仲佃再三申请免除税收，得百姓感激。

后改调福安市，县城墙新为倭寇所破，仲佃率兵五千，加速进城，缮治城墙，招抚流民。忽报倭寇至三洋，三洋民十余万阻于水不得渡。仲佃以渔舟济之，百姓获全。倭掠三洋无所得，复自三洋攻城。城中人因前祸而害怕，争先逃避。仲佃令曰：“吾与汝一同死守，听任妇女出城，男子逃出者，砍左右脚。”民乃止，死守三昼夜，倭寇终不能得逞。

不久，南京市刑曹。嘉靖四十四年（1565）十一月，转兵部武库清吏司主事。时海瑞下狱，仲佃与同僚竭急以救，为徐阶所阻，引为终生之憾。隆庆元年（1567），升兵部侍郎，出守成都市。值白莲教起义，百姓受死刑的有数百人。仲佃曲为宽宥。隆庆五年（1571），迁广东省按察副使，转惠潮副使，后调湖湘。

楚王，世子方襁褓。武岗王谋署府事，与王戚共盗楚王积蓄。仲佃权相张居正之意，按王戚于法，剥夺其武岗府事职务。万历元年（1573），居正复告知仲佃，方便其二子乡试。仲佃复拒之。张居正不悦，调参江右，巡按南昌市。宁州柯氏民相仇杀，宁州守张其事，请求剿灭。仲佃斥之。柯氏最后解散，守张其事得罪，仲佃升广东布政使。有因欺蒙朝廷而贬官的，怀疑仲佃，与前宁守一起构陷卢仲佃，卢仲佃于是左迁备兵惠潮。时流民占据山寨，兵不断，瘟疫流行。仲佃为劝降流民，积劳成疾，遇上瘴气，最终死于任上。

仲佃为人，性淡重然诺，节俭好施予，置义田千余以赈宗族。家居俭约，终身不畜姬妾。所著有《何莫轩集》数卷。

曾祖父卢楷，贡士；祖父卢；父卢谟，监生赠兵部员外郎。母郑氏，赠安人、加宜人。兄仲卿（生员）、仲器（监生）、弟仲山、仲岳、仲锦，俱监生；仲祁（生员）、仲（举人）、仲球（监生）、仲音（生员）、仲训（监生）、仲易、仲书、仲诗。