肉座菌科（Hypocreaceae），学名读音为ròu zuò jūn kē，是
肉座菌目（
粪壳菌纲）下的一个科。味甘性温，有益肺肾、止血、化痰的功效。肉座菌科通常以鲜艳的
担子菌门状子实体著称，如黄色、
橙色或红色。该科成立于1944年，由Giuseppe De Notaris创立。根据2008年出版的《真菌词典》，肉座菌科共有22个属和454个物种。2020年，该科被重新分析，确定拥有17个属和约658个物种。
的 1科，一般归属于
肉座菌目或。本科真菌有或无子座，如有则子座肉质，色泽鲜艳，埋生或表生于寄主的组织内，垫状、壳状、半球形或直立棒状；子囊果有真正的子囊壳壁，也为肉质并有鲜艳的色泽，埋生在子座内或表生在子座上，壁厚或薄膜质，有喙或具乳突，有或无孔口，有拟侧丝；子囊为单囊壁，壁薄，在顶部变厚，但不形成折光性的顶环或顶帽，遇碘不变蓝色，长形或球形，存留而不消解；子囊孢子无芽孔或芽缝，有线形、针形、纺锤形、蠕虫形等各种形状，两端有或无纤毛，平滑或有纹饰，无色或暗色，单胞或多胞，只有横隔膜或有纵横隔膜，孢子8个左右，有的8个双胞孢子可以在早期断裂成16个单胞孢子，成熟时强力射出，但有时可在子囊内出芽。
本科成员常可寄生在
维管植物上，也可寄生在粘菌、、海藻或其他真菌上，或腐生于植物残体、土中或粪上，或生在海水里的木段上。E.米勒和J.A.von阿尔克斯(1973)将本科下分30属，D.L.霍克斯沃思等人(1983)则分为76属。