《菌物研究》创刊于2003年，是国内公开发行的菌物科研性刊物。其宗旨是为菌物研究界的科研、教学、生产及管理人员等提供科学技术交流的园地，传播新成果、新技术信息，为促进菌物研究科学技术的发展服务。反映菌物的最新研究成果，促进中国国内外的学术交流与合作。
2014年12月，该刊成为原中国国家新闻出版广电总局第一批认定
学术期刊。
《菌物研究》主要报道有关菌物学（主要包括菌物生物学、菌物分类、菌物生态、菌物资源、菌物遗传与育种、菌物药化与
药理学、菌物栽培与加工、菌物药与功能食品开发等理论和应用方面）的综述、原创论文、研究报告、研究简报等内容。
《菌物研究》以
吉林农业大学为依托，截至2018年3月，学校有小麦和
玉蜀黍属深加工国家工程实验室、人参新品种选育与开发
国家地方联合工程研究中心、科技部食用菌新种质资源创制国际联合研究中心、动物生产及产品质量安全教育部重点实验室、农业部参茸产品质量安全风险评估实验室等15个国家和部委级科研平台，56个省级科研平台。
《菌物研究》被美国《
化学文摘》（CA）、美国《
生物学文摘》（BA）、《国际农业与生物科学中心数据库文摘》、中国学术期刊综合评价数据库、维普、中国知网、万方数据等收录。
据2018年9月15日中国知网显示，《菌物研究》总被下载150446次、总被引6121次、（2017版）复合影响因子为0.761、（2017版）综合影响因子为0.511。
据2018年9月15日
万方数据股份有限公司知识服务平台显示，《菌物研究》被引量为3961次，下载量为15251次；据2015年中国期刊引证报告（扩刊版）数据显示，《菌物研究》影响因子为0.41，在全部统计源期刊（6065种）中排第1995名。