太元年间,
司马曜下诏以司马柔之袭封齐王,延续
司马攸和
司马冏的祭祀,司马柔之历任
散骑常侍。太元年间,东晋新修宫殿,群臣写文章庆贺,司马柔之为贺首第一人,署名在太傅
司马道子之前。元兴元年二月丁巳(402年4月6日),会稽王司马道子将要讨伐
桓玄,派遣司马柔之兼任侍中,带着驺虞幡的旗帜宣布告慰
江州和
荆州市,命令桓玄停战。二月丁卯(402年4月16日),桓玄的前锋部队在姑孰击败了东晋的
中央军,司马柔之和谯王
司马尚之被杀害,朝廷追赠光禄勋。司马柔之的儿子司马建之被立为齐王,
宋武帝接受禅让建立
刘宋后,封国被撤除。