腥黑粉菌目科（学名：Tilletiaceae）为外担菌纲腥黑粉菌目的一个科，是一个单型目，只由一个科组成。

腥黑粉菌科的冬孢子单生或结合成永久性的孢子球。冬孢子萌发时，核就进行减数分裂，并继续分裂为8个单相核，然后才移入原菌丝。原菌丝无隔，如小麦网腥黑粉菌,顶生8个担孢子。半数为A1，半数为A2，两亲和担孢子互相结合成H形，质配时，H形一方的原生质流入另一方中，而后产生小梗，双核同时分裂产生新月形双核分生孢子。分生孢子生芽管入侵寄主，最后产生冬孢子球，由H形成员发生的双核菌丝也可不生分生孢子而直接侵染寄主。

腥黑粉菌科下分约13属250种。其中腥黑粉菌属最大，可生在植物各部位，但以子房为多，孢子单生，常有腥味，约90种，如小麦光黑腥粉菌、小麦网腥黑粉菌、谷子腥黑粉菌、稻粒黑粉菌。条黑粉菌目属的孢子结合成孢子球，中央为1至多个孢子，有一层不育细胞围生，约100种，如杆黑粉菌、芹菜根瘤黑粉菌等。叶黑粉菌属寄生在茎、叶组织中，不形成黑粉而形成病斑，约有90种，如稻叶黑粉菌。