长崎健司（日语：长崎 健司／ながさき けんじ 长崎市 Kenji，1979年2月12日—），日本男性动画导演、演出家。出身于大阪府枚方市。

长崎健司在2011年以《NO.6》作为导演首次亮相。自2016年起，他开始执导《我的英雄学院》的动画版。2020年8月16日，他执导的动画电影《我的英雄学院 OAD3 活下去！生与死的生存训练》在日本上映。2021年8月6日，他执导的动画电影《我的英雄学院：世界英雄任务》在日本上映。同年3月27日，他执导的动画《我的英雄学院 第5季》在日本播出，10月1日，他执导的动画《我的英雄学院 第6季》在日本播出。