江西省科学院创建于1958年，时为中国科学院江西分院，邵式平省长兼任院长，汪东兴副省长等十五人任副院长。1962年建有11个研究所（站），全院职工1000余人。因历史原因，1964年被撤销，1979年重新组建江西省科学院，成为直属于江西省人民政府唯一的综合型自然科学研究开发机构。

1958年，中国科学院江西分院创建。

1964年，中国科学院江西分院被撤消。

1979年7月，重新组建江西省科学院，成为直属于江西省人民政府的综合性自然科学研究开发机构。

2007年，江西省科学院在南昌市高新开发区购地100亩建设高科技研发与产业孵化基地。

2012年3月，江西省人民政府与中国科学院在北京签署了《江西省人民政府与中国科学院共建江西省科学院协议》。

据2018年7月科学院官网显示，科学院拥有6个省属独立研究所，6个院研发中心，拥有4个省级工程技术中心，3个省级重点实验室，4个省级优势科技创新团队，设有江西省科学院院士工作站。

省级重点实验室：江西省铜钨新材料重点实验室、江西省观赏植物遗传改良重点实验室

省级工程技术中心：江西省重金属污染生态修复工程技术中心、江西省天然产物绿色加工工程技术研究中心、江西省水污染控制及其能源利用工程技术研究中心、江西省生物化工工程技术研究中心

省属独立研究所：生物资源研究所、能源研究所、微生物研究所、应用物理研究所、应用化学研究所、科技战略研究所

省级科技创新团队：鹅掌楸属种质资源与种质创新团队、水污染控制与资源化知识创新团队、稀土铜材料技术创新团队、DL-乳酸及其衍生物技术创新团队

院研发中心：高科技开发中心、计算机培训中心、计算机信息中心、食品工程创新中心、低碳经济研究中心、鄱阳湖阳研究中心

据2018年7月科学院官网显示，科学院拥有Springer数据库、同方机构数字库、SCIE数据库、北京世纪超星信息技术发展有限责任公司数字资源库、超星汇雅电子图书数据库等数据库。

据2018年7月科学院官网显示，科学院先后共取得科研成果600余项，其中获省（部）以上奖励60项，获国家科学技术进步奖二等奖1项，省级科技进步二等奖15项；获国家专利40余项。20世纪80年代，该院牵头组织了江西省鄱阳湖多学科综合科学考察，完成了88万字的《鄱阳湖研究》学术专著。这项研究成果1990年获国家科技进步二等奖。

• 《江西科学》

《江西科学》系江西省科学院主办的自然科学综合性科学技术刊物，主要介绍江西省特别是江西省科学院的重大科研成果和阶段性科研总结，发表具有一定理论水平和实践价值的理、工、农、医及某些边缘学科的学术论文，有关江西省自然条件、自然资源的考察报告；报道中原地区国内外新理论、新学科的研究动态，本省和本院的重大学术活动；刊登有价值的文献综述和译文。辟有学术栏目：数理科学、化学科学、生命科学、地球科学、工程与材料科学、信息科学、管理科学、专栏等；曾获国家期刊奖、国家“双奖”期刊、国家“双效”期刊、中科双效期刊；1992年荣获首届全国优秀科技期刊三等奖；1997年荣获第二届全国优秀期刊三等奖；1996年荣获第二届江西省优秀科技期刊一等奖；2002年荣获第三届华东地区优秀期刊奖。

• 《生物化工》

《生物化工》杂志是国家期刊主管部门批准创办、中国国内外公开发行的自然科学学术期刊，主要登载生物制药、生物能源、环保、微生态制剂、化工新材料等生物化工领域的基础理论和应用研究的最新成果，及导向性的评论与综述，同时刊登重要科学问题讨论、研究简报、新技术、新方法和学术专著介绍等。

• 《热处理技术与装备》

《热处理技术与装备》栏目设有综述、材料研究、组织与性能、计算机应用、工艺、设备等。

• 《江西能源》

《江西能源》有调查报告、学术论文、国外文摘、工作建议、问题探讨、技术经验和知识介绍科技情报和小资料，并有节能新产品广告专栏等栏目。

2015年9月，经国家人力资源和社会保障部、全国博士后管理委员会批准，江西省科学院建立博士后科研工作站。建站以来，该院先后与南昌大学、中国科学院南京土壤研究所、中国科学院南京地理与湖泊研究所等多家博士后科研流动站，签订联合招收培养博士后科研人才协议。

江西省科学院分析测试中心为生产、环保、医疗、卫生、化工、医药等部门提供专业分析检测服务，为广东省省内外的政府部门检验，获得广东省科学技术厅认可的科研成果检测资格，承担科技部化学化工行业分析测试资源共享服务平台建设项目。

院徽外围为中英文对照的院名，标志采用蓝、粉、灰三种色彩。蓝色代表严谨和专业，粉色代表协作，灰色代表谦虚。

定位为先，人才为核，体系为要，创新为魂，理念为基

2020年4月，获得江西省平安江西建设领导小组“2019年度全省平安建设（综治工作）先进单位”表彰。