该片讲述了
康熙黄帝（
汤镇业饰）身体状况日渐衰竭，久病不起。国师求法得知，只有真命皇后和康熙阴阳互调才能治疗他的重疾。但是这真命皇后在遥远的300年后。好巧不巧，此时朝廷刚刚缴获了
吴三桂和罗刹国研发的时光穿越轮，
康熙帝只好找来福大命大的
韦小宝（
梁朝伟饰）执行这项特殊任务。韦小宝穿越到到1993的
香港特别行政区，结识市井之徒亚超（
张卫健饰），韦小宝和阿超可谓臭味相投，阿超带韦小宝见识了现代香港的花花世界，也从韦小宝身上搜刮了大量古董珍宝。
韦小宝按照国师的嘱托和道具委托阿超寻找真命皇后，在此期间，韦小宝对小霞（
吴雪雯饰）展开了大胆的求爱攻势。当韦小宝为自己得到小霞的感情窃窃自喜时，
建宁公主（
叶玉卿饰）和
双儿也穿越到了现代，新欢旧爱聚在一起，小霞赌气出走。此时，阿超也将阿霞就是真命皇后的消息告诉了
韦小宝，韦小宝自知闯下大祸。还没来得及处理完家务事，
吴三桂指派的杀手也穿越到现代追杀众人，关键时刻，阿超被陈进南上身，众人合力电死了杀手。最后，
韦小宝一行并没有回到古代，而
康熙也通过历史书得知自己有六十年寿命，惩治了妖言惑众的国师。
1992年，受到
周星驰主演的电影《
鹿鼎记》票房成功的启发，台湾片商邀请曾在电视剧版《鹿鼎记》中饰演韦小宝的
梁朝伟再拍一部电影版的。《正牌韦小宝之奉旨沟女》的剧本被创作出来，虽然相当无稽，但仍然决定进行拍摄。该片在北京进行取景拍摄，由
柯受良担任导演，他邀请了众多演员参与拍摄。
该片将主角穿越的使命由“救世”转至“沟女”，将娱乐效果发挥到了极致。看完该片，必须佩服一些
香港特别行政区影人的弱智和天真，不过情理不通倒也罢了，该片连香港最擅长的声、像、画和动作也全部欠缺，梁朝伟的表演也让人讨厌。
梁朝伟在该片中再次颠覆人们对于韦小宝的认知。光是两撇八字眉外加中分油头长辫就充满了浪子气息，再搭配上梁朝伟那双桃花电眼，于是有了史上最浪“韦小宝”。（
新浪娱乐、
国际在线、腾讯娱乐评）
梁朝伟在1984年的《
鹿鼎记》中饰演的“韦小宝”造型深入民心，但此番打出“正牌韦小宝”旗号，却在造型上有了大翻转。穿越至现代后，韦小宝由长辫改绑马尾辫，再穿上休闲西装，又俨然一副20世纪90年代情场老手之面貌，而在观众眼里，韦小宝穿西装、夹克、衬衫、长裤及皮鞋的造型，本身就是一大充满颠覆意义的笑点所在；而到了结尾，在很多的“
鹿鼎记”版本中一向穿古装跟敌手对打的韦小宝，居然穿着一件三色相间的毛衣出手，观众也憋不住了，只有大笑，韦小宝打架还不忘跟上现代时装的品味潮流，非常难得。（
新浪娱乐评）