乾隆二十七年(1762)由山东按察使迁湖北布政使,后历官
广东省布政使、江宁布政使。
乾隆三十四年(1769)经
黄冈市知县温鹤立,
黄州府知府潘振莹报
问津书院原由绅士义捐,绅士经理,从未归公办。但县吏因官办河东书院经费不足,而干预问津书院。鹗元即批问津仍归绅士管理,其他人等不得干预。使问津书院办学经费得以保障,士子拍手称颂。
乾隆四十一年(1776),以都察院右
都御史兼
兵部侍郎,
巡抚安徽4年。期间上疏称风、、寿三郡历年灾荒,赈贷皆由
安庆市、
池州市远途拨运,不如就近建仓贮粮,以备急需。在风阳府、寿州
凤台县及
正阳关镇、
颍州府届
亳州市、
阜阳市、
霍邱县、
蒙城县、
太和县、
颍上县等县共建粮仓400间,贮粮20万石,以备赈恤。乾隆四十五年(1780)调任
江苏巡抚。
闵鹗元以文学起家,名扬中外。精于治狱,由郎中起司。所到之处,以清理积案见称。他在京城倡建吴兴会馆,同乡进京如回家一般。巡抚
江苏省10年,一时号为贤能。期间,在
苏州市经营
湖州市绸缎的同乡苦于没有公所,出面聚资在苏州曹家巷建立
会馆。
在乾隆朝,闵鹗元两次考绩都位居
巡抚之最,但因不依附权相
和珅终被忌。
乾隆五十五年(1790)以失察罪被革职,请求告老,次年致仕奉旨回原籍。
爱新觉罗·颙琰二年(1797)逝世。