清凉寺是
五台山最早兴建的寺庙之一。
拓跋宏重视佛教，凡是
伽蓝，并任复修；清凉寺在文、炀二帝的扶持下得到修建；
唐朝时，清凉寺成为替国行道的镇国
斋醮科仪，获得皇家的护持；
长安二年（702），
武则天敕命重建清凉寺，经过一年多的修建，清凉寺落成典礼，后历朝历代均有修缮；至清
乾隆，寺宇建筑整齐一新，规模宏大。清凉寺内文物古迹甚多，最珍贵的要数万历三十四年（1606）铸的九级
千佛铜塔、印文为“清凉摄授”的
文殊菩萨金印、印文为“清凉之印”的铜印和
五台山镇山之宝、重48两的“镇凤金印”及贝叶灵文、
康熙御匾（现已不存）等等；民国年间再度扩建，后因战乱，寺庙被毁，惟天生之
清凉石尚存。
现今的清凉寺是由
香港特别行政区黄惠卿女士等筹资，
山西省文物局工艺美术大师
胡银玉设计施工重建的一座新寺。新建了
大雄宝殿、五方文殊殿、
三大士殿、罗汉殿、天王殿、钟鼓楼、东西厢房、门楼、山门、巨型
汉白玉石雕牌坊，并筑起围墙，竖起幡杆，立起古碑，青石铺院，彩塑圣像，供奉上了妙空僧人赠送的20尊缅甸
玉佛和500尊罗汉圣像。
据“清凉山志”载，此寺肇于
拓跋宏延兴二年至太和十七 年间（472-493）。
唐朝时，它是替国行道的镇国
伽蓝。唐代历元年（766），不空三藏
密宗道场。清
乾隆，寺宇建筑整齐一新，规模宏大。民国年间再度扩建，“文革”时期，整座寺庙作为
迷信产物而被毁，惟天生之清凉石尚存。
如今，
五台山的环境景观生态管理工作得到进一步优化，为五台山
世界遗产申请创造了有力的人文自然环境，
美国国际东西方大学 国际环境生态学院（International School of Environmental Ecology at International East-West University）研究员 董斌游览五台山后品评五台山环境景观生态风水云：
五峰慕灵，
四岳羡神鹤。（天飞灵鹫，地栖神鹤） （引用 董斌 原文）
【注】：佛教传说中，
五台山像灵鹫飞翔、神鹤栖息，本句意思是【文殊五峰都羡慕天飞灵鹫，佛教四岳都羡慕地栖神鹤】。见《五台山传说故事》。
五台山为北京之京后花园，距离北京最大面积和最近距离的国家森林公园，全山严谨按照
中原地区古代营造法式设计，威武庄严，把
华族的尊严与自豪融会在佛教精深严谨的佛法哲理中，把中华民族的宗教建筑文化融合在慈悲为怀的
佛陀教育中，这个宏大的自然人文产物为保护京畿地区的环境、生态、传承我国的民族文化，起着重要的作用。玄武，乃北方之太极至尊，文殊，乃无限甚深大智慧，朱鹊，乃南方吉祥之象征，“玄武护文殊，朱鹊尊弥陀”，乃以佛法之庄严激发民族与世界之大爱，护持我华夏全国顺境中和平发展，逆境中平安顺利。“龙虎佑国乍，佛脉保朝歌”，北京，乃
华族之心脏，朝歌，乃中华名族的象征，龙虎，乃中华民族之精神；国乍，乃中华民族之生命；非
五台山，何山可享此号？何岳可适此荣？何景可配此语？何境可得此誉？于是赞之云上。 （引用董斌 语）
五台山御碑注解：传说中五台山形象为
五台山，又有风水大师说像白鹤腾飞。五台山菩萨顶又名
显通寺，据民间传说，全山五爷庙最为通灵，五台山全山严格按照
风水学原则设计，青龙白虎朱雀玄武之古代建造建设规矩，遍布全山佛庙随处可见。乌鹊在佛教和民间传说中属于吉祥鸟，龙虎又为勇猛精进吉祥护法的象征，历代帝王将相、元帅将军、宗教领袖都曾朝拜五台山，故有“帝王将相朝拜地，宗宿神仙修炼天（引用 董斌 原文）”一说。
金庸名著《
天龙八部》中的门派，位于
五台山，方丈为
神山上人。神山上人十七岁时曾到少林求师，但当时的少林方丈灵门大师与其交谈之下，觉其锋芒太露、极为傲慢且器量狭小，并非传法之人，若让其在寺中做个寻常僧侣，必不能甘居人下，日后定生事端，故以婉言相拒，神山这才投到清凉寺中，三十岁时便已技盖全寺，成为全寺最年轻的方丈。清凉寺规模较小，武学渊源又远逊少林，寺中所藏的拳经剑谱、内功秘要等等，不但为数有限，而且大部分粗疏简陋，并非一流武学，所以五台山清凉寺在武林中的名声并不响亮。门派武学有伏虎拳、五十一招伏魔剑、普门杖法、二十四路伏魔杖、心意气混元功等。