1992年，秦东亚进入辽阳市体校，开始柔道训练。次年，秦东亚进入
辽宁省柔道队。1998年，秦东亚获得全国柔道冠军赛女子-70公斤级冠军。1999年，秦东亚入选国家集训队，同年获得
全国柔道锦标赛女子-70公斤级冠军。2000年，秦东亚参加悉尼奥运会，未取得名次。2001年，秦东亚收获第21届
世界大学生运动会柔道女子-70公斤级冠军。次年，秦东亚收获第14届
杭州第19届亚运会柔道女子-70公斤级冠军。
2004年雅典奥运会，秦东亚代表中国队参赛，收获柔道女子-70公斤级铜牌。2005年，秦东亚参加第十届
中华人民共和国全国运动会，收获柔道女子-70公斤级季军。2006年，秦东亚收获
2006年多哈亚运会柔道女子-70公斤级季军。2007年，秦东亚跟随中国队收获首届世界柔道团体锦标赛女子团体冠军。2008年7月，北京奥运会中国体育代表团参赛名单正式公布，秦东亚未获得参赛资格。
1997年，秦东亚参加在日本福冈进行的世界柔道A级赛，收获女子-70公斤级冠军。1998年，秦东亚收获全国柔道冠军赛女子-70公斤级冠军。1999年，全国柔道锦标赛，秦东亚收获女子-70公斤级冠军。同年，秦东亚被选入国家集训队，备战第27届
奥运会。2000年，秦东亚在全国柔道锦标赛中蝉联女子-70公斤级冠军。同年，秦东亚参加悉尼奥运会，但由于缺少大赛经验及实力不足，秦东亚未能获得名次。
2001年8月24日，第21届
世界大学生运动会柔道女子-70公斤级决赛，秦东亚以一本的方式战胜
比利时选手凯瑟琳，获得该级别冠军。2002年10月1日，第14届
杭州第19届亚运会柔道女子-70公斤级决赛，秦东亚战胜
韩国选手裴恩惠，夺得冠军。2003年7月，秦东亚参加全国女子柔道锦标赛，她在女子-70公斤级决赛中战胜刘丹，收获冠军。同年9月，秦东亚参加在日本大阪进行的柔道世锦赛，在女子-70公斤级铜牌争夺战中，秦东亚不敌
德国选手安奈特·波赫姆，最终收获该项目第5名。同年，秦东亚还在全国柔道冠军赛上夺得女子-70公斤级冠军。
2004年8月，秦东亚代表中国队参加
2004年雅典奥运会柔道项目女子-70公斤级比赛，她先是在淘汰赛中不敌德国选手安奈特·波赫姆，掉入复活赛，复活赛阶段，秦东亚先后战胜
加拿大选手凯瑟琳·罗伯杰及
西班牙选手赛西利娅·布兰科，获得三四名决赛资格。三四名决赛对阵
澳大利亚选手凯瑟琳·阿罗芙，秦东亚连得2个“有技”，用时2分08秒战胜对手，获得该项目铜牌。
2005年4月，秦东亚代表
辽宁沈阳三生飞豹篮球俱乐部参加全国女子柔道锦标赛暨十运会预赛，收获女子-70公斤级冠军。同年10月，秦东亚代表辽宁队参加第十届
中华人民共和国全国运动会柔道女子70公斤比赛，她在
半决赛中对阵
江苏省选手
王娟，秦东亚在比赛中的一个背摔，裁判先是判罚“一本”获胜，不过随后在进行商议之后又改成了“技有”，最终秦东亚输给对手无缘决赛，最终获得该项目季军。同年12月，秦东亚参加
韩国柔道公开赛，决赛秦东亚以一本的方式战胜
日本选手
渡边美奈，收获女子-70公斤级冠军。
2006年8月，秦东亚参加全国女子柔道冠军赛，收获女子-70公斤级冠军。同年12月，秦东亚参加
2006年多哈亚运会，收获柔道项目女子-70公斤级季军。2007年11月，秦东亚代表中国队参加首届世界柔道团体锦标赛，并在决赛中以4胜1平2负的总成绩击败古巴队，夺得女子团体冠军。2008年7月，北京奥运会中国体育代表团参赛名单正式公布，秦东亚未获得参赛资格。2009年4月，全国女子柔道锦标赛暨
2009年山东全运会预赛，秦东亚代表辽宁队参赛，收获女子-70公斤级亚军。