遗址范围南北长450米，东西宽400米，面积近18万平方米，现高出地面约1．5米。内涵包括两个方面：一是
春秋时超王勾践进攻
吴国所筑屯兵土城的遗迹，尚有残存于城址南北两面长约30米、高约4米的城垣；二是土城底下的大量
新石器时代的文化遗存，这是遗址的主要内涵。
据（苏州府志》记载，越城"－云越王城，又云勾践城。越伐吴，吴王在姑苏，越筑此城以逼之。"春秋晚期，
姬匄四十二年（前478年），越王勾践率军大举攻吴，从
太湖挖渠（即越来溪）北上，并于
石湖东北筑土城屯兵，隔水与西面磨盘山上的吴军对峙。
周元王三年（前473年），越军乘太湖水涨之机，由越来溪人
胥江，直逼姑苏城下，一举灭亡
吴国。
吴越相争时留下的这座土城，直到
南宋还比较完整。
范成大《
吴郡志》说它"雉宛然"。《苏州府志》所载更详："城堞仿佛具在，商者犹丈余，阔亦三丈，而辐员不甚广。"考古学家
卫聚贤早在1936年就作过专门调查。1953年文物考古工作者对其作了测量，发现土城呈不规则圆形，城址南北两面残留着断续的夯土城垣，俗称黄壁山。
1960年
江苏省文物工作队对遗址进行了正式发掘。共开挖探方4个，发掘面积98平方米，文化堆积最厚处达8．21米，清理出
马家浜遗址、良渚文化时期的墓葬10座，发现了以几何印纹陶为特点的西周--战国时代文化、以灰陶和黑衣陶为主的早期良渚文化和以夹砂陶、泥质红陶为特点的马家浜文化依次叠压的
地层关系。
遗址下层的马家浜文化距今约6000年左右，中层的良渚文化距今5500年左右。良渚文化层出土的生产工具，有磨制得相当精细的有肩穿孔石斧、有段石、耘田器和石镰等。陶器有鱼鳍形足罐形鼎、宽流阔把杯、贯耳壶、竹节把豆、钵形豆、折腹罐、盆等。这些遗物具有泽文化向典型良渚文化过渡期遗物的特征。