影片主要讲述了南北两派醉拳一决高下的故事。北派千醉翁将醉拳与螳螂拳结合，自创一套“醉螳螂”，为了证明北醉拳天下第一，带着徒弟南下和南醉拳苏花子一比高下。最终被苏花子和师弟共同的徒弟苏朦打败。
声名远扬的醉拳分为南北醉拳两派，其形有异，其理相通。南醉拳以苏花子（袁小田 饰）为首，以一套炉火纯青的醉八仙纵横武林，从未有敌手。沧州千醉翁（黄正利 饰）是北派醉拳代表人物，此人心高气傲，对苏花子的名声心有不服，自己暗中苦练，将醉拳和螳螂拳结合，使其招式更加凌厉多变，自创一套新拳法“醉螳螂”。随即带着徒弟阿元（元奎 饰）南下寻找苏花子一决高下。
苏花子常年在外云游，想找到他并非易事。恰逢苏花子回到家中，见到妻子收养的义子苏朦（
袁信义 饰）。苏朦为人忠厚老实，心地善良。知道
苏灿武功高强后，一心想和苏花子学习醉拳。但苏花子看他并不是
武学奇才，不愿意传授于他。耐不住苏朦的一心求学，为了磨砺苏朦，苏花子把一些奇怪的训练招数教给了苏朦。苏朦白天在酒楼当伙计，晚上和苏花子学习醉拳。
千醉翁和徒弟阿元一心寻找苏花子，苏朦得知二人要挑战苏花子，而且言辞嚣张，便想出手教训二人。可惜，苏朦的“醉拳歪招”中看不中用，结果被千醉翁的徒弟一顿暴打。千醉翁和苏花子偶遇，稍作寒暄后边动起手，千以独创的醉螳螂将苏花子打成重伤。在苏朦帮助下逃离了酒楼。
苏朦为苏花子抓药途中遇到了睡在棺材里面的怪人，怪人调包了苏朦的药，苏花子吃了这些药后，虽然治好了内伤，但却一直拉肚子。苏朦推测是怪人在药里做了手脚，于是前去找他理论。与怪人一番争执之后，得知怪人是苏花子的师弟药君（
任世官 饰）。得知苏花子被打伤后，病君将自己的“探脉手”教给了苏朦，经过病君的指点，苏朦将醉拳与探脉手相结合，拳法显著提高。
苏花子病好之后来到病君家门前，正好遇到了想要斩草除根的千醉翁，两人再次过招，但苏花子仍不敌千醉翁。苏朦正好出现，与千醉翁对招，苏朦将醉拳与探脉手结合发挥到极致，最终打败了千醉翁。
《南北醉拳》是从《醉拳》片延伸出来的，也是《醉拳》原班制作人马的回归。导演仍然是
袁和平，袁和平的父亲
袁小田再度饰演苏花子这一角色，弟弟
袁信义则饰演影片中苏朦一角，由《
醉拳》中大反派“阎铁心”的
黄正利出演片中反派千醉翁，增加由
元奎饰演的徒弟阿元，希望通过苏朦和阿元的互动，带动影片的诙谐风格。影片整体设计水平还是很高。